Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLKQ9UBE8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLKQ9UBE8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLKQ9UBE8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLKQ9UBE8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLKQ9UBE8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLKQ9UBE8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLKQ9UBE8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLKQ9UBE8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLKQ9UBE8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLKQ9UBE8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLKQ9UBE8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLKQ9UBE8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLKQ9UBE8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLKQ9UBE8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLKQ9UBE8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLKQ9UBE8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLKQ9UBE8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLKQ9UBE8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLKQ9UBE8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLKQ9UBE8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLKQ9UBE8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLKQ9UBE8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLKQ9UBE8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLKQ9UBE8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLKQ9UBE8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLKQ9UBE8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLKQ9UBE8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NLKQ9UBE8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NLKQ9UBE8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLKQ9UBE8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLKQ9UBE8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLKQ9UBE8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLKQ9UBE8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLKQ9UBE8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLKQ9UBE8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLKQ9UBE8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLKQ9UBE8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLKQ9UBE8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLKQ9UBE8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLKQ9UBE8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLKQ9UBE8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLKQ9UBE8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLKQ9UBE8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLKQ9UBE8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLKQ9UBE8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms