Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDHAF3Q9NRP4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SDHAF3Q9NRP4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDHAF3Q9NRP4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SDHAF3Q9NRP4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SDHAF3Q9NRP4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SDHAF3Q9NRP4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDHAF3Q9NRP4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDHAF3Q9NRP4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDHAF3Q9NRP4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHAF3Q9NRP4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHAF3Q9NRP4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHAF3Q9NRP4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDHAF3Q9NRP4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDHAF3Q9NRP4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDHAF3Q9NRP4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDHAF3Q9NRP4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDHAF3Q9NRP4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDHAF3Q9NRP4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDHAF3Q9NRP4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDHAF3Q9NRP4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SDHAF3Q9NRP4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SDHAF3Q9NRP4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDHAF3Q9NRP4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDHAF3Q9NRP4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHAF3Q9NRP4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHAF3Q9NRP4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDHAF3Q9NRP4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDHAF3Q9NRP4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDHAF3Q9NRP4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDHAF3Q9NRP4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDHAF3Q9NRP4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SDHAF3Q9NRP4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDHAF3Q9NRP4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDHAF3Q9NRP4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDHAF3Q9NRP4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDHAF3Q9NRP4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDHAF3Q9NRP4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF3Q9NRP4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF3Q9NRP4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF3Q9NRP4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF3Q9NRP4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF3Q9NRP4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDHAF3Q9NRP4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDHAF3Q9NRP4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDHAF3Q9NRP4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDHAF3Q9NRP4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDHAF3Q9NRP4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDHAF3Q9NRP4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDHAF3Q9NRP4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDHAF3Q9NRP4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDHAF3Q9NRP4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SDHAF3Q9NRP4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDHAF3Q9NRP4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SDHAF3Q9NRP4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDHAF3Q9NRP4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDHAF3Q9NRP4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDHAF3Q9NRP4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDHAF3Q9NRP4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDHAF3Q9NRP4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDHAF3Q9NRP4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SDHAF3Q9NRP4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDHAF3Q9NRP4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDHAF3Q9NRP4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDHAF3Q9NRP4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDHAF3Q9NRP4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDHAF3Q9NRP4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms