Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms