Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DLL4Q9NR61 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DLL4Q9NR61 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL4Q9NR61 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DLL4Q9NR61 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms