Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C8orf4Q9NR00 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C8orf4Q9NR00 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C8orf4Q9NR00 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C8orf4Q9NR00 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C8orf4Q9NR00 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C8orf4Q9NR00 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C8orf4Q9NR00 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C8orf4Q9NR00 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C8orf4Q9NR00 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C8orf4Q9NR00 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C8orf4Q9NR00 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C8orf4Q9NR00 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf4Q9NR00 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf4Q9NR00 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf4Q9NR00 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf4Q9NR00 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf4Q9NR00 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf4Q9NR00 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf4Q9NR00 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf4Q9NR00 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf4Q9NR00 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf4Q9NR00 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C8orf4Q9NR00 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf4Q9NR00 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf4Q9NR00 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf4Q9NR00 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf4Q9NR00 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf4Q9NR00 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C8orf4Q9NR00 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C8orf4Q9NR00 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C8orf4Q9NR00 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C8orf4Q9NR00 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C8orf4Q9NR00 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8orf4Q9NR00 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8orf4Q9NR00 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8orf4Q9NR00 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8orf4Q9NR00 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf4Q9NR00 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf4Q9NR00 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf4Q9NR00 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf4Q9NR00 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf4Q9NR00 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8orf4Q9NR00 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8orf4Q9NR00 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf4Q9NR00 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf4Q9NR00 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf4Q9NR00 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8orf4Q9NR00 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8orf4Q9NR00 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8orf4Q9NR00 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8orf4Q9NR00 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8orf4Q9NR00 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8orf4Q9NR00 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8orf4Q9NR00 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8orf4Q9NR00 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8orf4Q9NR00 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8orf4Q9NR00 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8orf4Q9NR00 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C8orf4Q9NR00 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C8orf4Q9NR00 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C8orf4Q9NR00 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8orf4Q9NR00 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C8orf4Q9NR00 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C8orf4Q9NR00 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C8orf4Q9NR00 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf4Q9NR00 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C8orf4Q9NR00 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C8orf4Q9NR00 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8orf4Q9NR00 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8orf4Q9NR00 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf4Q9NR00 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf4Q9NR00 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf4Q9NR00 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf4Q9NR00 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf4Q9NR00 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C8orf4Q9NR00 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms