Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM9Q9NQV7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM9Q9NQV7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM9Q9NQV7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM9Q9NQV7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM9Q9NQV7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM9Q9NQV7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM9Q9NQV7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM9Q9NQV7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM9Q9NQV7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM9Q9NQV7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM9Q9NQV7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM9Q9NQV7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM9Q9NQV7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM9Q9NQV7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM9Q9NQV7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM9Q9NQV7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM9Q9NQV7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM9Q9NQV7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM9Q9NQV7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM9Q9NQV7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM9Q9NQV7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM9Q9NQV7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM9Q9NQV7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM9Q9NQV7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM9Q9NQV7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM9Q9NQV7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM9Q9NQV7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM9Q9NQV7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM9Q9NQV7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM9Q9NQV7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM9Q9NQV7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM9Q9NQV7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM9Q9NQV7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM9Q9NQV7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM9Q9NQV7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM9Q9NQV7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM9Q9NQV7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM9Q9NQV7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM9Q9NQV7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM9Q9NQV7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM9Q9NQV7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM9Q9NQV7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM9Q9NQV7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM9Q9NQV7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM9Q9NQV7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM9Q9NQV7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM9Q9NQV7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM9Q9NQV7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM9Q9NQV7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM9Q9NQV7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM9Q9NQV7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM9Q9NQV7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM9Q9NQV7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM9Q9NQV7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM9Q9NQV7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM9Q9NQV7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM9Q9NQV7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms