Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA4AQ9H3S1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA4AQ9H3S1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA4AQ9H3S1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA4AQ9H3S1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA4AQ9H3S1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA4AQ9H3S1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA4AQ9H3S1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA4AQ9H3S1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA4AQ9H3S1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA4AQ9H3S1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA4AQ9H3S1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA4AQ9H3S1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA4AQ9H3S1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA4AQ9H3S1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA4AQ9H3S1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA4AQ9H3S1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA4AQ9H3S1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA4AQ9H3S1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA4AQ9H3S1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA4AQ9H3S1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA4AQ9H3S1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA4AQ9H3S1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA4AQ9H3S1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA4AQ9H3S1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA4AQ9H3S1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA4AQ9H3S1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA4AQ9H3S1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA4AQ9H3S1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA4AQ9H3S1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA4AQ9H3S1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA4AQ9H3S1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA4AQ9H3S1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA4AQ9H3S1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA4AQ9H3S1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA4AQ9H3S1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA4AQ9H3S1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA4AQ9H3S1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA4AQ9H3S1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA4AQ9H3S1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA4AQ9H3S1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA4AQ9H3S1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA4AQ9H3S1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA4AQ9H3S1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA4AQ9H3S1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA4AQ9H3S1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA4AQ9H3S1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA4AQ9H3S1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA4AQ9H3S1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA4AQ9H3S1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA4AQ9H3S1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA4AQ9H3S1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SEMA4AQ9H3S1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA4AQ9H3S1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA4AQ9H3S1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEMA4AQ9H3S1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SEMA4AQ9H3S1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA4AQ9H3S1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA4AQ9H3S1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA4AQ9H3S1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA4AQ9H3S1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA4AQ9H3S1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA4AQ9H3S1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA4AQ9H3S1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA4AQ9H3S1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA4AQ9H3S1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA4AQ9H3S1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA4AQ9H3S1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA4AQ9H3S1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA4AQ9H3S1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA4AQ9H3S1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA4AQ9H3S1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA4AQ9H3S1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA4AQ9H3S1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA4AQ9H3S1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA4AQ9H3S1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA4AQ9H3S1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA4AQ9H3S1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA4AQ9H3S1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms