Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 MLF1-204ENST00000466246 653 ntTSL 27.38□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 MLF1-207ENST00000477042 750 ntTSL 56.86□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.018e-15■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.228e-15■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 LRRFIP1-212ENST00000483443 1069 ntTSL 312.28□□□□□ -0.448e-15■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 FOXN3-211ENST00000555855 851 ntTSL 518.55■□□□□ 0.566e-7■■■■■ 36.9
CSTF2TQ9H0L4 FOXN3-206ENST00000554005 450 ntTSL 57.9□□□□□ -1.144e-7■■■■■ 36.9
CSTF2TQ9H0L4 FOXN3-203ENST00000553353 366 ntTSL 34.33□□□□□ -1.724e-7■■■■■ 36.9
CSTF2TQ9H0L4 PHF23-207ENST00000573826 685 ntTSL 318.17■□□□□ 0.53e-10■■■■■ 36.8
CSTF2TQ9H0L4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.063e-10■■■■■ 36.8
CSTF2TQ9H0L4 HINFP-201ENST00000350777 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.144e-6■■■■■ 36.8
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 36.8
CSTF2TQ9H0L4 PQLC1-205ENST00000469369 593 ntTSL 412.83□□□□□ -0.365e-8■■■■■ 36.6
CSTF2TQ9H0L4 PQLC1-209ENST00000589000 558 ntTSL 410.84□□□□□ -0.675e-8■■■■■ 36.6
CSTF2TQ9H0L4 GOLPH3-202ENST00000503610 1074 ntTSL 330.29■■■□□ 2.446e-19■■■■■ 36.6
CSTF2TQ9H0L4 GOLPH3-203ENST00000512668 665 ntTSL 321.52■■□□□ 1.046e-19■■■■■ 36.6
CSTF2TQ9H0L4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.446e-19■■■■■ 36.6
CSTF2TQ9H0L4 AC016700.3-201ENST00000455541 448 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.925e-9■■■■■ 36.5
CSTF2TQ9H0L4 MBNL2-206ENST00000469707 2574 ntTSL 1 (best)7.81□□□□□ -1.162e-10■■■■■ 36.5
CSTF2TQ9H0L4 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.372e-10■■■■■ 36.5
CSTF2TQ9H0L4 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.412e-10■■■■■ 36.5
CSTF2TQ9H0L4 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.472e-10■■■■■ 36.5
CSTF2TQ9H0L4 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.532e-10■■■■■ 36.5
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-206ENST00000542215 1592 ntTSL 217.14■□□□□ 0.334e-8■■■■■ 36.4
CSTF2TQ9H0L4 LINC01606-204ENST00000519241 509 ntTSL 318.05■□□□□ 0.485e-9■■■■■ 36.4
CSTF2TQ9H0L4 LINC01606-209ENST00000523341 714 ntTSL 312.13□□□□□ -0.475e-9■■■■■ 36.4
CSTF2TQ9H0L4 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.545e-9■■■■■ 36.4
CSTF2TQ9H0L4 LINC01606-202ENST00000518556 473 ntTSL 37.77□□□□□ -1.175e-9■■■■■ 36.4
CSTF2TQ9H0L4 LINC01606-205ENST00000519314 562 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.235e-9■■■■■ 36.4
CSTF2TQ9H0L4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 36.4
CSTF2TQ9H0L4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 36.4
CSTF2TQ9H0L4 MDM2-219ENST00000493419 577 ntTSL 213.16□□□□□ -0.31e-8■■■■■ 36.4
CSTF2TQ9H0L4 MDM2-204ENST00000311420 1583 ntTSL 510.17□□□□□ -0.781e-8■■■■■ 36.4
CSTF2TQ9H0L4 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.131e-8■■■■■ 36.4
CSTF2TQ9H0L4 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.181e-8■■■■■ 36.4
CSTF2TQ9H0L4 MDM2-213ENST00000393417 1683 ntTSL 57.2□□□□□ -1.261e-8■■■■■ 36.4
CSTF2TQ9H0L4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.244e-10■■■■■ 36.3
CSTF2TQ9H0L4 CDYL-202ENST00000343762 3241 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.644e-10■■■■■ 36.3
CSTF2TQ9H0L4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.321e-18■■■■■ 36.2
CSTF2TQ9H0L4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.816e-9■■■■■ 36.2
CSTF2TQ9H0L4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.116e-9■■■■■ 36.2
CSTF2TQ9H0L4 PRPSAP2-212ENST00000466106 1419 ntTSL 214.15□□□□□ -0.146e-9■■■■■ 36.2
CSTF2TQ9H0L4 PRPSAP2-228ENST00000610773 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.66e-9■■■■■ 36.2
CSTF2TQ9H0L4 PRPSAP2-215ENST00000492129 1835 ntTSL 1 (best)11□□□□□ -0.656e-9■■■■■ 36.2
CSTF2TQ9H0L4 FOXN3-204ENST00000553840 555 ntTSL 416.72■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 36.2
CSTF2TQ9H0L4 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 36.2
CSTF2TQ9H0L4 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 36.2
CSTF2TQ9H0L4 FOXN3-218ENST00000557718 398 ntTSL 56.04□□□□□ -1.444e-7■■■■■ 36.2
CSTF2TQ9H0L4 FOXN3-213ENST00000556916 467 ntTSL 35.48□□□□□ -1.534e-7■■■■■ 36.2
CSTF2TQ9H0L4 PQLC1-204ENST00000466449 2887 ntTSL 215.93■□□□□ 0.148e-8■■■■■ 36.2
CSTF2TQ9H0L4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.066e-10■■■■■ 36.2
CSTF2TQ9H0L4 SYNCRIP-203ENST00000444272 610 ntTSL 313.8□□□□□ -0.26e-10■■■■■ 36.2
CSTF2TQ9H0L4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.946e-8■■■■■ 36.1
CSTF2TQ9H0L4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 36.1
CSTF2TQ9H0L4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.189e-9■■■■■ 36.1
CSTF2TQ9H0L4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.428e-8■■■■■ 36
CSTF2TQ9H0L4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.368e-8■■■■■ 36
CSTF2TQ9H0L4 PQLC1-206ENST00000474967 2319 ntTSL 518.34■□□□□ 0.538e-8■■■■■ 36
CSTF2TQ9H0L4 PQLC1-201ENST00000351365 2414 ntTSL 217.16■□□□□ 0.348e-8■■■■■ 36
CSTF2TQ9H0L4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 36
CSTF2TQ9H0L4 TFG-205ENST00000479672 776 ntTSL 321.86■■□□□ 1.091e-10■■■■■ 36
CSTF2TQ9H0L4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.721e-10■■■■■ 36
CSTF2TQ9H0L4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.691e-10■■■■■ 36
CSTF2TQ9H0L4 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.451e-10■■■■■ 36
CSTF2TQ9H0L4 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.531e-10■■■■■ 36
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1E-208ENST00000431611 814 ntTSL 514.37□□□□□ -0.111e-8■■■■■ 35.9
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1E-209ENST00000431632 763 ntTSL 213.31□□□□□ -0.281e-8■■■■■ 35.9
CSTF2TQ9H0L4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.338e-7■■■■■ 35.9
CSTF2TQ9H0L4 NUMBL-210ENST00000600636 555 ntTSL 415.15■□□□□ 0.028e-7■■■■■ 35.9
CSTF2TQ9H0L4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 35.9
CSTF2TQ9H0L4 LINC00894-204ENST00000444489 2951 ntTSL 510.42□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 35.9
CSTF2TQ9H0L4 MXI1-206ENST00000442296 634 ntTSL 511.8□□□□□ -0.527e-10■■■■■ 35.8
CSTF2TQ9H0L4 MXI1-210ENST00000485566 2755 ntTSL 1 (best)8.23□□□□□ -1.095e-10■■■■■ 35.8
CSTF2TQ9H0L4 ITPK1-203ENST00000553452 609 ntTSL 523.32■■□□□ 1.322e-6■■■■■ 35.8
CSTF2TQ9H0L4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 35.8
CSTF2TQ9H0L4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 35.8
CSTF2TQ9H0L4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 35.8
CSTF2TQ9H0L4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 35.8
CSTF2TQ9H0L4 ITPK1-206ENST00000554999 667 ntTSL 513.08□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 35.8
CSTF2TQ9H0L4 ITPK1-209ENST00000556185 691 ntTSL 512.64□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 35.8
CSTF2TQ9H0L4 ITPK1-212ENST00000557309 770 ntTSL 311.88□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 35.8
CSTF2TQ9H0L4 ITPK1-208ENST00000555553 727 ntTSL 38.71□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 35.8
CSTF2TQ9H0L4 SRRM2-216ENST00000573583 543 ntTSL 49.68□□□□□ -0.867e-11■■■■■ 35.6
CSTF2TQ9H0L4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.655e-7■■■■■ 35.6
CSTF2TQ9H0L4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.365e-7■■■■■ 35.6
CSTF2TQ9H0L4 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.045e-7■■■■■ 35.6
CSTF2TQ9H0L4 VPS37B-203ENST00000535765 879 ntTSL 321.9■■□□□ 1.13e-10■■■■■ 35.6
CSTF2TQ9H0L4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.293e-10■■■■■ 35.6
CSTF2TQ9H0L4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.142e-7■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 PCF11-203ENST00000530304 2649 ntTSL 1 (best)17.97■□□□□ 0.479e-8■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 PCF11-206ENST00000533018 580 ntTSL 316.91■□□□□ 0.39e-8■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 PCF11-204ENST00000530660 3309 ntTSL 214□□□□□ -0.179e-8■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.499e-8■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 TMEM91-208ENST00000537354 450 ntTSL 310.79□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 MFSD10-203ENST00000503596 1589 ntTSL 518.72■□□□□ 0.595e-9■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.525e-9■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.495e-9■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.45e-9■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.35e-9■■■■■ 35.5
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