Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PARD6BQ9BYG5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARD6BQ9BYG5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARD6BQ9BYG5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARD6BQ9BYG5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARD6BQ9BYG5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARD6BQ9BYG5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARD6BQ9BYG5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARD6BQ9BYG5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARD6BQ9BYG5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARD6BQ9BYG5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARD6BQ9BYG5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARD6BQ9BYG5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARD6BQ9BYG5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARD6BQ9BYG5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARD6BQ9BYG5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PARD6BQ9BYG5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PARD6BQ9BYG5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PARD6BQ9BYG5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PARD6BQ9BYG5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PARD6BQ9BYG5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PARD6BQ9BYG5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PARD6BQ9BYG5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARD6BQ9BYG5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PARD6BQ9BYG5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARD6BQ9BYG5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARD6BQ9BYG5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARD6BQ9BYG5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PARD6BQ9BYG5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PARD6BQ9BYG5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PARD6BQ9BYG5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PARD6BQ9BYG5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARD6BQ9BYG5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARD6BQ9BYG5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARD6BQ9BYG5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARD6BQ9BYG5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARD6BQ9BYG5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARD6BQ9BYG5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARD6BQ9BYG5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARD6BQ9BYG5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARD6BQ9BYG5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARD6BQ9BYG5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARD6BQ9BYG5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARD6BQ9BYG5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARD6BQ9BYG5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARD6BQ9BYG5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARD6BQ9BYG5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARD6BQ9BYG5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PARD6BQ9BYG5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PARD6BQ9BYG5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARD6BQ9BYG5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARD6BQ9BYG5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARD6BQ9BYG5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARD6BQ9BYG5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARD6BQ9BYG5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARD6BQ9BYG5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARD6BQ9BYG5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARD6BQ9BYG5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARD6BQ9BYG5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PARD6BQ9BYG5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARD6BQ9BYG5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARD6BQ9BYG5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARD6BQ9BYG5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARD6BQ9BYG5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARD6BQ9BYG5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARD6BQ9BYG5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARD6BQ9BYG5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARD6BQ9BYG5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARD6BQ9BYG5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARD6BQ9BYG5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PARD6BQ9BYG5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARD6BQ9BYG5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARD6BQ9BYG5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARD6BQ9BYG5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARD6BQ9BYG5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARD6BQ9BYG5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARD6BQ9BYG5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARD6BQ9BYG5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARD6BQ9BYG5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARD6BQ9BYG5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms