Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF4Q9BUZ4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF4Q9BUZ4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF4Q9BUZ4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF4Q9BUZ4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF4Q9BUZ4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF4Q9BUZ4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF4Q9BUZ4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF4Q9BUZ4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF4Q9BUZ4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF4Q9BUZ4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF4Q9BUZ4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF4Q9BUZ4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF4Q9BUZ4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF4Q9BUZ4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF4Q9BUZ4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF4Q9BUZ4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF4Q9BUZ4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF4Q9BUZ4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF4Q9BUZ4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF4Q9BUZ4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF4Q9BUZ4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF4Q9BUZ4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF4Q9BUZ4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF4Q9BUZ4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF4Q9BUZ4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF4Q9BUZ4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF4Q9BUZ4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF4Q9BUZ4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF4Q9BUZ4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF4Q9BUZ4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF4Q9BUZ4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF4Q9BUZ4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF4Q9BUZ4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF4Q9BUZ4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF4Q9BUZ4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF4Q9BUZ4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms