Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC77Q9BR77 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC77Q9BR77 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC77Q9BR77 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC77Q9BR77 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC77Q9BR77 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC77Q9BR77 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC77Q9BR77 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC77Q9BR77 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC77Q9BR77 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC77Q9BR77 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC77Q9BR77 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC77Q9BR77 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC77Q9BR77 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC77Q9BR77 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC77Q9BR77 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC77Q9BR77 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC77Q9BR77 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC77Q9BR77 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC77Q9BR77 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC77Q9BR77 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC77Q9BR77 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC77Q9BR77 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC77Q9BR77 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC77Q9BR77 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC77Q9BR77 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC77Q9BR77 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC77Q9BR77 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC77Q9BR77 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC77Q9BR77 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC77Q9BR77 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC77Q9BR77 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC77Q9BR77 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC77Q9BR77 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC77Q9BR77 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC77Q9BR77 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC77Q9BR77 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC77Q9BR77 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC77Q9BR77 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC77Q9BR77 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC77Q9BR77 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC77Q9BR77 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC77Q9BR77 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC77Q9BR77 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC77Q9BR77 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC77Q9BR77 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC77Q9BR77 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC77Q9BR77 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC77Q9BR77 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC77Q9BR77 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC77Q9BR77 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC77Q9BR77 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC77Q9BR77 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC77Q9BR77 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC77Q9BR77 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC77Q9BR77 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC77Q9BR77 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC77Q9BR77 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC77Q9BR77 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC77Q9BR77 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC77Q9BR77 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC77Q9BR77 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC77Q9BR77 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC77Q9BR77 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC77Q9BR77 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC77Q9BR77 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC77Q9BR77 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC77Q9BR77 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC77Q9BR77 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC77Q9BR77 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC77Q9BR77 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC77Q9BR77 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC77Q9BR77 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC77Q9BR77 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC77Q9BR77 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC77Q9BR77 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC77Q9BR77 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC77Q9BR77 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC77Q9BR77 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms