Protein–RNA interactions for Protein: Q99828

CIB1, Calcium and integrin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB1Q99828 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIB1Q99828 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIB1Q99828 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIB1Q99828 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIB1Q99828 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIB1Q99828 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIB1Q99828 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIB1Q99828 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIB1Q99828 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIB1Q99828 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIB1Q99828 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIB1Q99828 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIB1Q99828 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIB1Q99828 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIB1Q99828 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIB1Q99828 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIB1Q99828 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIB1Q99828 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIB1Q99828 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIB1Q99828 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIB1Q99828 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CIB1Q99828 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CIB1Q99828 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CIB1Q99828 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CIB1Q99828 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIB1Q99828 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIB1Q99828 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIB1Q99828 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIB1Q99828 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIB1Q99828 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIB1Q99828 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIB1Q99828 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIB1Q99828 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIB1Q99828 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIB1Q99828 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CIB1Q99828 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CIB1Q99828 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIB1Q99828 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIB1Q99828 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIB1Q99828 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIB1Q99828 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIB1Q99828 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIB1Q99828 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIB1Q99828 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIB1Q99828 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIB1Q99828 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CIB1Q99828 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CIB1Q99828 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CIB1Q99828 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CIB1Q99828 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIB1Q99828 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIB1Q99828 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIB1Q99828 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIB1Q99828 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIB1Q99828 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIB1Q99828 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIB1Q99828 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIB1Q99828 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CIB1Q99828 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIB1Q99828 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIB1Q99828 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIB1Q99828 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIB1Q99828 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIB1Q99828 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms