Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA0

PCDHB18P, Putative protocadherin beta-18, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB18PQ96TA0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB18PQ96TA0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB18PQ96TA0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB18PQ96TA0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB18PQ96TA0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB18PQ96TA0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB18PQ96TA0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB18PQ96TA0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB18PQ96TA0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB18PQ96TA0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB18PQ96TA0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB18PQ96TA0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB18PQ96TA0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB18PQ96TA0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB18PQ96TA0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB18PQ96TA0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB18PQ96TA0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB18PQ96TA0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB18PQ96TA0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB18PQ96TA0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB18PQ96TA0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB18PQ96TA0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCDHB18PQ96TA0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB18PQ96TA0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB18PQ96TA0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB18PQ96TA0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB18PQ96TA0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB18PQ96TA0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB18PQ96TA0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB18PQ96TA0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB18PQ96TA0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB18PQ96TA0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB18PQ96TA0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB18PQ96TA0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB18PQ96TA0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB18PQ96TA0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB18PQ96TA0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB18PQ96TA0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB18PQ96TA0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB18PQ96TA0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB18PQ96TA0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB18PQ96TA0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB18PQ96TA0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB18PQ96TA0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB18PQ96TA0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB18PQ96TA0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB18PQ96TA0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB18PQ96TA0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB18PQ96TA0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB18PQ96TA0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB18PQ96TA0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB18PQ96TA0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB18PQ96TA0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB18PQ96TA0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB18PQ96TA0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB18PQ96TA0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB18PQ96TA0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB18PQ96TA0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB18PQ96TA0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PCDHB18PQ96TA0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB18PQ96TA0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB18PQ96TA0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB18PQ96TA0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB18PQ96TA0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB18PQ96TA0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB18PQ96TA0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB18PQ96TA0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB18PQ96TA0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB18PQ96TA0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB18PQ96TA0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB18PQ96TA0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB18PQ96TA0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB18PQ96TA0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB18PQ96TA0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB18PQ96TA0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB18PQ96TA0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB18PQ96TA0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB18PQ96TA0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB18PQ96TA0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB18PQ96TA0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB18PQ96TA0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms