Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZIM3Q96PE6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZIM3Q96PE6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZIM3Q96PE6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZIM3Q96PE6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZIM3Q96PE6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZIM3Q96PE6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZIM3Q96PE6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZIM3Q96PE6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZIM3Q96PE6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZIM3Q96PE6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZIM3Q96PE6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZIM3Q96PE6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZIM3Q96PE6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZIM3Q96PE6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZIM3Q96PE6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZIM3Q96PE6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZIM3Q96PE6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZIM3Q96PE6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZIM3Q96PE6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZIM3Q96PE6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZIM3Q96PE6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZIM3Q96PE6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ZIM3Q96PE6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZIM3Q96PE6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZIM3Q96PE6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZIM3Q96PE6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZIM3Q96PE6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZIM3Q96PE6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZIM3Q96PE6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZIM3Q96PE6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZIM3Q96PE6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZIM3Q96PE6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZIM3Q96PE6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZIM3Q96PE6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZIM3Q96PE6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZIM3Q96PE6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZIM3Q96PE6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZIM3Q96PE6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZIM3Q96PE6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZIM3Q96PE6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZIM3Q96PE6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZIM3Q96PE6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZIM3Q96PE6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZIM3Q96PE6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZIM3Q96PE6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZIM3Q96PE6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZIM3Q96PE6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZIM3Q96PE6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZIM3Q96PE6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZIM3Q96PE6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZIM3Q96PE6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZIM3Q96PE6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZIM3Q96PE6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZIM3Q96PE6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZIM3Q96PE6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZIM3Q96PE6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZIM3Q96PE6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZIM3Q96PE6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZIM3Q96PE6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZIM3Q96PE6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZIM3Q96PE6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZIM3Q96PE6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZIM3Q96PE6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZIM3Q96PE6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZIM3Q96PE6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZIM3Q96PE6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ZIM3Q96PE6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZIM3Q96PE6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZIM3Q96PE6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZIM3Q96PE6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZIM3Q96PE6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZIM3Q96PE6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZIM3Q96PE6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZIM3Q96PE6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZIM3Q96PE6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZIM3Q96PE6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZIM3Q96PE6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZIM3Q96PE6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZIM3Q96PE6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZIM3Q96PE6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms