Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
LRRC7Q96NW7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
LRRC7Q96NW7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.02■■■■□ 3.68
LRRC7Q96NW7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
LRRC7Q96NW7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
LRRC7Q96NW7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
LRRC7Q96NW7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
LRRC7Q96NW7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
LRRC7Q96NW7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
LRRC7Q96NW7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
LRRC7Q96NW7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
LRRC7Q96NW7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
LRRC7Q96NW7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
LRRC7Q96NW7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
LRRC7Q96NW7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRC7Q96NW7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRRC7Q96NW7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRRC7Q96NW7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
LRRC7Q96NW7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
LRRC7Q96NW7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
LRRC7Q96NW7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
LRRC7Q96NW7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
LRRC7Q96NW7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
LRRC7Q96NW7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LRRC7Q96NW7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRC7Q96NW7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
LRRC7Q96NW7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
LRRC7Q96NW7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
LRRC7Q96NW7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
LRRC7Q96NW7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRC7Q96NW7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRC7Q96NW7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRC7Q96NW7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
LRRC7Q96NW7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
LRRC7Q96NW7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
LRRC7Q96NW7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
LRRC7Q96NW7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
LRRC7Q96NW7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
LRRC7Q96NW7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC7Q96NW7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC7Q96NW7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
LRRC7Q96NW7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
LRRC7Q96NW7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.63
LRRC7Q96NW7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
LRRC7Q96NW7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRC7Q96NW7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
LRRC7Q96NW7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
LRRC7Q96NW7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
LRRC7Q96NW7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
LRRC7Q96NW7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
LRRC7Q96NW7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
LRRC7Q96NW7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
LRRC7Q96NW7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
LRRC7Q96NW7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
LRRC7Q96NW7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
LRRC7Q96NW7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
LRRC7Q96NW7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
LRRC7Q96NW7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
LRRC7Q96NW7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
LRRC7Q96NW7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
LRRC7Q96NW7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
LRRC7Q96NW7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
LRRC7Q96NW7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
LRRC7Q96NW7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LRRC7Q96NW7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
LRRC7Q96NW7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
LRRC7Q96NW7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LRRC7Q96NW7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
LRRC7Q96NW7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
LRRC7Q96NW7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
LRRC7Q96NW7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
LRRC7Q96NW7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
LRRC7Q96NW7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
LRRC7Q96NW7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
LRRC7Q96NW7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
LRRC7Q96NW7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
LRRC7Q96NW7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
LRRC7Q96NW7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LRRC7Q96NW7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LRRC7Q96NW7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
LRRC7Q96NW7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
LRRC7Q96NW7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
LRRC7Q96NW7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
LRRC7Q96NW7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LRRC7Q96NW7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LRRC7Q96NW7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
LRRC7Q96NW7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
LRRC7Q96NW7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
LRRC7Q96NW7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
LRRC7Q96NW7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LRRC7Q96NW7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LRRC7Q96NW7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LRRC7Q96NW7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LRRC7Q96NW7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
LRRC7Q96NW7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
LRRC7Q96NW7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
LRRC7Q96NW7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
LRRC7Q96NW7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LRRC7Q96NW7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
LRRC7Q96NW7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms