Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB1

FOPNL, LisH domain-containing protein FOPNL, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOPNLQ96NB1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOPNLQ96NB1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOPNLQ96NB1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOPNLQ96NB1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOPNLQ96NB1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOPNLQ96NB1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOPNLQ96NB1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOPNLQ96NB1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FOPNLQ96NB1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOPNLQ96NB1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOPNLQ96NB1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOPNLQ96NB1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOPNLQ96NB1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOPNLQ96NB1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOPNLQ96NB1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOPNLQ96NB1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOPNLQ96NB1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOPNLQ96NB1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOPNLQ96NB1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOPNLQ96NB1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOPNLQ96NB1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOPNLQ96NB1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOPNLQ96NB1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOPNLQ96NB1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOPNLQ96NB1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOPNLQ96NB1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOPNLQ96NB1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FOPNLQ96NB1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOPNLQ96NB1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FOPNLQ96NB1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOPNLQ96NB1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOPNLQ96NB1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOPNLQ96NB1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOPNLQ96NB1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOPNLQ96NB1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOPNLQ96NB1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOPNLQ96NB1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOPNLQ96NB1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FOPNLQ96NB1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOPNLQ96NB1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOPNLQ96NB1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOPNLQ96NB1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOPNLQ96NB1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOPNLQ96NB1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOPNLQ96NB1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOPNLQ96NB1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOPNLQ96NB1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOPNLQ96NB1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOPNLQ96NB1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOPNLQ96NB1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOPNLQ96NB1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOPNLQ96NB1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOPNLQ96NB1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOPNLQ96NB1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOPNLQ96NB1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOPNLQ96NB1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOPNLQ96NB1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOPNLQ96NB1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOPNLQ96NB1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOPNLQ96NB1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOPNLQ96NB1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOPNLQ96NB1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOPNLQ96NB1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms