Protein–RNA interactions for Protein: Q96E52

OMA1, Metalloendopeptidase OMA1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OMA1Q96E52 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
OMA1Q96E52 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OMA1Q96E52 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OMA1Q96E52 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OMA1Q96E52 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
OMA1Q96E52 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
OMA1Q96E52 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OMA1Q96E52 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OMA1Q96E52 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OMA1Q96E52 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OMA1Q96E52 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OMA1Q96E52 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OMA1Q96E52 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OMA1Q96E52 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OMA1Q96E52 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
OMA1Q96E52 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OMA1Q96E52 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OMA1Q96E52 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OMA1Q96E52 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OMA1Q96E52 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OMA1Q96E52 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OMA1Q96E52 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OMA1Q96E52 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OMA1Q96E52 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OMA1Q96E52 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OMA1Q96E52 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OMA1Q96E52 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OMA1Q96E52 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OMA1Q96E52 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OMA1Q96E52 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OMA1Q96E52 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OMA1Q96E52 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OMA1Q96E52 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OMA1Q96E52 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OMA1Q96E52 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OMA1Q96E52 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OMA1Q96E52 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OMA1Q96E52 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OMA1Q96E52 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OMA1Q96E52 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OMA1Q96E52 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms