Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ULK4Q96C45 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ULK4Q96C45 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ULK4Q96C45 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ULK4Q96C45 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ULK4Q96C45 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ULK4Q96C45 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ULK4Q96C45 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ULK4Q96C45 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ULK4Q96C45 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ULK4Q96C45 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ULK4Q96C45 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ULK4Q96C45 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ULK4Q96C45 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ULK4Q96C45 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ULK4Q96C45 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ULK4Q96C45 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ULK4Q96C45 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ULK4Q96C45 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ULK4Q96C45 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ULK4Q96C45 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ULK4Q96C45 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ULK4Q96C45 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ULK4Q96C45 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ULK4Q96C45 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ULK4Q96C45 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ULK4Q96C45 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ULK4Q96C45 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ULK4Q96C45 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ULK4Q96C45 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ULK4Q96C45 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ULK4Q96C45 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ULK4Q96C45 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ULK4Q96C45 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ULK4Q96C45 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ULK4Q96C45 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ULK4Q96C45 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ULK4Q96C45 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ULK4Q96C45 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ULK4Q96C45 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ULK4Q96C45 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ULK4Q96C45 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ULK4Q96C45 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ULK4Q96C45 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ULK4Q96C45 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ULK4Q96C45 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ULK4Q96C45 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ULK4Q96C45 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ULK4Q96C45 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ULK4Q96C45 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ULK4Q96C45 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms