Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A6Q92581 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A6Q92581 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A6Q92581 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A6Q92581 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9A6Q92581 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9A6Q92581 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A6Q92581 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A6Q92581 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A6Q92581 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A6Q92581 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A6Q92581 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A6Q92581 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A6Q92581 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A6Q92581 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A6Q92581 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A6Q92581 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A6Q92581 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A6Q92581 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A6Q92581 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A6Q92581 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A6Q92581 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A6Q92581 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A6Q92581 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A6Q92581 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A6Q92581 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A6Q92581 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A6Q92581 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A6Q92581 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A6Q92581 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A6Q92581 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC9A6Q92581 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC9A6Q92581 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A6Q92581 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A6Q92581 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A6Q92581 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A6Q92581 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A6Q92581 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A6Q92581 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A6Q92581 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A6Q92581 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A6Q92581 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A6Q92581 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A6Q92581 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A6Q92581 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A6Q92581 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A6Q92581 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A6Q92581 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms