Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR60Q8WVS4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR60Q8WVS4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR60Q8WVS4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR60Q8WVS4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR60Q8WVS4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR60Q8WVS4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR60Q8WVS4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR60Q8WVS4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR60Q8WVS4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR60Q8WVS4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR60Q8WVS4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR60Q8WVS4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR60Q8WVS4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR60Q8WVS4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR60Q8WVS4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR60Q8WVS4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR60Q8WVS4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR60Q8WVS4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR60Q8WVS4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR60Q8WVS4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR60Q8WVS4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR60Q8WVS4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
WDR60Q8WVS4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR60Q8WVS4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR60Q8WVS4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR60Q8WVS4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR60Q8WVS4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR60Q8WVS4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR60Q8WVS4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR60Q8WVS4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR60Q8WVS4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR60Q8WVS4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR60Q8WVS4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR60Q8WVS4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR60Q8WVS4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR60Q8WVS4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR60Q8WVS4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR60Q8WVS4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR60Q8WVS4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR60Q8WVS4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR60Q8WVS4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR60Q8WVS4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR60Q8WVS4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR60Q8WVS4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR60Q8WVS4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR60Q8WVS4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR60Q8WVS4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR60Q8WVS4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR60Q8WVS4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR60Q8WVS4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR60Q8WVS4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR60Q8WVS4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR60Q8WVS4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
WDR60Q8WVS4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR60Q8WVS4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR60Q8WVS4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR60Q8WVS4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR60Q8WVS4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR60Q8WVS4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR60Q8WVS4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR60Q8WVS4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR60Q8WVS4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR60Q8WVS4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR60Q8WVS4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR60Q8WVS4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR60Q8WVS4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR60Q8WVS4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR60Q8WVS4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR60Q8WVS4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR60Q8WVS4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WDR60Q8WVS4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WDR60Q8WVS4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WDR60Q8WVS4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WDR60Q8WVS4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR60Q8WVS4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms