Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVI0

SMIM4, Small integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4Q8WVI0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM4Q8WVI0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM4Q8WVI0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM4Q8WVI0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM4Q8WVI0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM4Q8WVI0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM4Q8WVI0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM4Q8WVI0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM4Q8WVI0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM4Q8WVI0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM4Q8WVI0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM4Q8WVI0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM4Q8WVI0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM4Q8WVI0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM4Q8WVI0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM4Q8WVI0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM4Q8WVI0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM4Q8WVI0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM4Q8WVI0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM4Q8WVI0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM4Q8WVI0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM4Q8WVI0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM4Q8WVI0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM4Q8WVI0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM4Q8WVI0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM4Q8WVI0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM4Q8WVI0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM4Q8WVI0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM4Q8WVI0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM4Q8WVI0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM4Q8WVI0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM4Q8WVI0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM4Q8WVI0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM4Q8WVI0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM4Q8WVI0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM4Q8WVI0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM4Q8WVI0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM4Q8WVI0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM4Q8WVI0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM4Q8WVI0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM4Q8WVI0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM4Q8WVI0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM4Q8WVI0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM4Q8WVI0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM4Q8WVI0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM4Q8WVI0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM4Q8WVI0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM4Q8WVI0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM4Q8WVI0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM4Q8WVI0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM4Q8WVI0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM4Q8WVI0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM4Q8WVI0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM4Q8WVI0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM4Q8WVI0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM4Q8WVI0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM4Q8WVI0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM4Q8WVI0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM4Q8WVI0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM4Q8WVI0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM4Q8WVI0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM4Q8WVI0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM4Q8WVI0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM4Q8WVI0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM4Q8WVI0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM4Q8WVI0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM4Q8WVI0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM4Q8WVI0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM4Q8WVI0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM4Q8WVI0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM4Q8WVI0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM4Q8WVI0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM4Q8WVI0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms