Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPC24Q8NBT2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPC24Q8NBT2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPC24Q8NBT2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPC24Q8NBT2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPC24Q8NBT2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPC24Q8NBT2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPC24Q8NBT2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPC24Q8NBT2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPC24Q8NBT2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPC24Q8NBT2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPC24Q8NBT2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPC24Q8NBT2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPC24Q8NBT2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPC24Q8NBT2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPC24Q8NBT2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPC24Q8NBT2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPC24Q8NBT2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPC24Q8NBT2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPC24Q8NBT2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPC24Q8NBT2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SPC24Q8NBT2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPC24Q8NBT2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPC24Q8NBT2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPC24Q8NBT2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPC24Q8NBT2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPC24Q8NBT2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPC24Q8NBT2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPC24Q8NBT2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPC24Q8NBT2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPC24Q8NBT2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPC24Q8NBT2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPC24Q8NBT2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPC24Q8NBT2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPC24Q8NBT2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPC24Q8NBT2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPC24Q8NBT2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPC24Q8NBT2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPC24Q8NBT2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPC24Q8NBT2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPC24Q8NBT2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPC24Q8NBT2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPC24Q8NBT2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPC24Q8NBT2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPC24Q8NBT2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SPC24Q8NBT2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPC24Q8NBT2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPC24Q8NBT2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPC24Q8NBT2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPC24Q8NBT2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPC24Q8NBT2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPC24Q8NBT2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPC24Q8NBT2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPC24Q8NBT2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPC24Q8NBT2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPC24Q8NBT2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPC24Q8NBT2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPC24Q8NBT2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPC24Q8NBT2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPC24Q8NBT2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPC24Q8NBT2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms