Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00528Q8N1L1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00528Q8N1L1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00528Q8N1L1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00528Q8N1L1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00528Q8N1L1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00528Q8N1L1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00528Q8N1L1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00528Q8N1L1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00528Q8N1L1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00528Q8N1L1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00528Q8N1L1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00528Q8N1L1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00528Q8N1L1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms