Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD3Q8N144 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJD3Q8N144 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJD3Q8N144 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJD3Q8N144 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD3Q8N144 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD3Q8N144 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD3Q8N144 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD3Q8N144 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJD3Q8N144 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJD3Q8N144 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD3Q8N144 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD3Q8N144 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD3Q8N144 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD3Q8N144 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD3Q8N144 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJD3Q8N144 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJD3Q8N144 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJD3Q8N144 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJD3Q8N144 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD3Q8N144 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD3Q8N144 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD3Q8N144 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJD3Q8N144 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJD3Q8N144 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJD3Q8N144 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJD3Q8N144 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD3Q8N144 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD3Q8N144 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJD3Q8N144 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJD3Q8N144 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJD3Q8N144 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJD3Q8N144 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJD3Q8N144 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GJD3Q8N144 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJD3Q8N144 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD3Q8N144 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJD3Q8N144 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJD3Q8N144 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJD3Q8N144 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJD3Q8N144 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJD3Q8N144 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJD3Q8N144 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJD3Q8N144 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD3Q8N144 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD3Q8N144 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD3Q8N144 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD3Q8N144 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD3Q8N144 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD3Q8N144 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD3Q8N144 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD3Q8N144 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJD3Q8N144 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJD3Q8N144 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GJD3Q8N144 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJD3Q8N144 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJD3Q8N144 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD3Q8N144 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD3Q8N144 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD3Q8N144 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GJD3Q8N144 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJD3Q8N144 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD3Q8N144 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD3Q8N144 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD3Q8N144 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJD3Q8N144 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJD3Q8N144 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJD3Q8N144 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GJD3Q8N144 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GJD3Q8N144 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GJD3Q8N144 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GJD3Q8N144 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GJD3Q8N144 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJD3Q8N144 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJD3Q8N144 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD3Q8N144 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD3Q8N144 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD3Q8N144 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD3Q8N144 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD3Q8N144 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD3Q8N144 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD3Q8N144 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJD3Q8N144 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJD3Q8N144 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJD3Q8N144 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJD3Q8N144 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJD3Q8N144 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJD3Q8N144 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJD3Q8N144 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD3Q8N144 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD3Q8N144 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD3Q8N144 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD3Q8N144 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD3Q8N144 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD3Q8N144 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD3Q8N144 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJD3Q8N144 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GJD3Q8N144 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJD3Q8N144 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJD3Q8N144 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms