Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV5

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q86YV5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PRAG1Q86YV5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PRAG1Q86YV5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PRAG1Q86YV5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PRAG1Q86YV5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PRAG1Q86YV5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PRAG1Q86YV5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PRAG1Q86YV5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PRAG1Q86YV5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PRAG1Q86YV5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PRAG1Q86YV5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PRAG1Q86YV5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PRAG1Q86YV5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PRAG1Q86YV5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PRAG1Q86YV5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PRAG1Q86YV5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PRAG1Q86YV5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PRAG1Q86YV5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PRAG1Q86YV5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
PRAG1Q86YV5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PRAG1Q86YV5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PRAG1Q86YV5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PRAG1Q86YV5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PRAG1Q86YV5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PRAG1Q86YV5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PRAG1Q86YV5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PRAG1Q86YV5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PRAG1Q86YV5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PRAG1Q86YV5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PRAG1Q86YV5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PRAG1Q86YV5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PRAG1Q86YV5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PRAG1Q86YV5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PRAG1Q86YV5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRAG1Q86YV5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRAG1Q86YV5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRAG1Q86YV5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PRAG1Q86YV5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PRAG1Q86YV5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PRAG1Q86YV5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PRAG1Q86YV5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PRAG1Q86YV5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PRAG1Q86YV5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PRAG1Q86YV5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
PRAG1Q86YV5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PRAG1Q86YV5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PRAG1Q86YV5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PRAG1Q86YV5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PRAG1Q86YV5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRAG1Q86YV5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRAG1Q86YV5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PRAG1Q86YV5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PRAG1Q86YV5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRAG1Q86YV5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRAG1Q86YV5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.62
PRAG1Q86YV5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
PRAG1Q86YV5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PRAG1Q86YV5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PRAG1Q86YV5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PRAG1Q86YV5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PRAG1Q86YV5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRAG1Q86YV5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PRAG1Q86YV5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PRAG1Q86YV5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PRAG1Q86YV5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PRAG1Q86YV5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PRAG1Q86YV5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PRAG1Q86YV5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRAG1Q86YV5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRAG1Q86YV5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PRAG1Q86YV5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PRAG1Q86YV5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PRAG1Q86YV5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PRAG1Q86YV5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PRAG1Q86YV5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PRAG1Q86YV5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PRAG1Q86YV5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PRAG1Q86YV5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PRAG1Q86YV5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PRAG1Q86YV5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PRAG1Q86YV5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms