Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX20Q7Z614 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX20Q7Z614 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX20Q7Z614 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX20Q7Z614 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX20Q7Z614 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX20Q7Z614 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX20Q7Z614 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX20Q7Z614 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX20Q7Z614 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX20Q7Z614 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX20Q7Z614 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX20Q7Z614 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX20Q7Z614 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX20Q7Z614 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX20Q7Z614 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX20Q7Z614 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX20Q7Z614 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX20Q7Z614 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX20Q7Z614 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX20Q7Z614 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX20Q7Z614 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX20Q7Z614 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX20Q7Z614 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX20Q7Z614 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX20Q7Z614 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX20Q7Z614 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX20Q7Z614 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX20Q7Z614 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SNX20Q7Z614 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX20Q7Z614 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX20Q7Z614 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX20Q7Z614 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX20Q7Z614 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX20Q7Z614 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX20Q7Z614 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX20Q7Z614 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX20Q7Z614 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX20Q7Z614 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX20Q7Z614 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX20Q7Z614 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX20Q7Z614 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX20Q7Z614 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX20Q7Z614 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX20Q7Z614 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX20Q7Z614 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX20Q7Z614 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX20Q7Z614 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX20Q7Z614 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNX20Q7Z614 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX20Q7Z614 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX20Q7Z614 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX20Q7Z614 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX20Q7Z614 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms