Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
KRT27Q7Z3Y8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KRT27Q7Z3Y8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
KRT27Q7Z3Y8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KRT27Q7Z3Y8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KRT27Q7Z3Y8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KRT27Q7Z3Y8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KRT27Q7Z3Y8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KRT27Q7Z3Y8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KRT27Q7Z3Y8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
KRT27Q7Z3Y8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KRT27Q7Z3Y8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KRT27Q7Z3Y8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KRT27Q7Z3Y8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
KRT27Q7Z3Y8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
KRT27Q7Z3Y8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
KRT27Q7Z3Y8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
KRT27Q7Z3Y8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KRT27Q7Z3Y8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
KRT27Q7Z3Y8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
KRT27Q7Z3Y8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
KRT27Q7Z3Y8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KRT27Q7Z3Y8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KRT27Q7Z3Y8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
KRT27Q7Z3Y8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
KRT27Q7Z3Y8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
KRT27Q7Z3Y8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
KRT27Q7Z3Y8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KRT27Q7Z3Y8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
KRT27Q7Z3Y8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
KRT27Q7Z3Y8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
KRT27Q7Z3Y8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
KRT27Q7Z3Y8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
KRT27Q7Z3Y8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
KRT27Q7Z3Y8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KRT27Q7Z3Y8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KRT27Q7Z3Y8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
KRT27Q7Z3Y8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
KRT27Q7Z3Y8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
KRT27Q7Z3Y8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
KRT27Q7Z3Y8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
KRT27Q7Z3Y8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
KRT27Q7Z3Y8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KRT27Q7Z3Y8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KRT27Q7Z3Y8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KRT27Q7Z3Y8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KRT27Q7Z3Y8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KRT27Q7Z3Y8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KRT27Q7Z3Y8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KRT27Q7Z3Y8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
KRT27Q7Z3Y8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
KRT27Q7Z3Y8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KRT27Q7Z3Y8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
KRT27Q7Z3Y8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
KRT27Q7Z3Y8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KRT27Q7Z3Y8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
KRT27Q7Z3Y8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
KRT27Q7Z3Y8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KRT27Q7Z3Y8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KRT27Q7Z3Y8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
KRT27Q7Z3Y8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
KRT27Q7Z3Y8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
KRT27Q7Z3Y8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KRT27Q7Z3Y8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
KRT27Q7Z3Y8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
KRT27Q7Z3Y8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
KRT27Q7Z3Y8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
KRT27Q7Z3Y8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KRT27Q7Z3Y8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KRT27Q7Z3Y8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KRT27Q7Z3Y8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KRT27Q7Z3Y8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KRT27Q7Z3Y8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KRT27Q7Z3Y8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KRT27Q7Z3Y8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KRT27Q7Z3Y8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KRT27Q7Z3Y8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
KRT27Q7Z3Y8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KRT27Q7Z3Y8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KRT27Q7Z3Y8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KRT27Q7Z3Y8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KRT27Q7Z3Y8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
KRT27Q7Z3Y8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
KRT27Q7Z3Y8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KRT27Q7Z3Y8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
KRT27Q7Z3Y8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
KRT27Q7Z3Y8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
KRT27Q7Z3Y8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KRT27Q7Z3Y8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
KRT27Q7Z3Y8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
KRT27Q7Z3Y8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KRT27Q7Z3Y8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
KRT27Q7Z3Y8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
KRT27Q7Z3Y8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KRT27Q7Z3Y8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
KRT27Q7Z3Y8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
KRT27Q7Z3Y8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
KRT27Q7Z3Y8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
KRT27Q7Z3Y8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms