Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3D4

LYSMD3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD3Q7Z3D4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LYSMD3Q7Z3D4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LYSMD3Q7Z3D4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LYSMD3Q7Z3D4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LYSMD3Q7Z3D4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LYSMD3Q7Z3D4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LYSMD3Q7Z3D4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LYSMD3Q7Z3D4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LYSMD3Q7Z3D4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LYSMD3Q7Z3D4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LYSMD3Q7Z3D4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LYSMD3Q7Z3D4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LYSMD3Q7Z3D4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LYSMD3Q7Z3D4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LYSMD3Q7Z3D4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LYSMD3Q7Z3D4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LYSMD3Q7Z3D4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LYSMD3Q7Z3D4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LYSMD3Q7Z3D4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LYSMD3Q7Z3D4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LYSMD3Q7Z3D4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LYSMD3Q7Z3D4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LYSMD3Q7Z3D4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LYSMD3Q7Z3D4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LYSMD3Q7Z3D4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LYSMD3Q7Z3D4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LYSMD3Q7Z3D4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LYSMD3Q7Z3D4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LYSMD3Q7Z3D4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LYSMD3Q7Z3D4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LYSMD3Q7Z3D4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LYSMD3Q7Z3D4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LYSMD3Q7Z3D4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LYSMD3Q7Z3D4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LYSMD3Q7Z3D4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LYSMD3Q7Z3D4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LYSMD3Q7Z3D4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LYSMD3Q7Z3D4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LYSMD3Q7Z3D4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LYSMD3Q7Z3D4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LYSMD3Q7Z3D4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LYSMD3Q7Z3D4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LYSMD3Q7Z3D4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LYSMD3Q7Z3D4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LYSMD3Q7Z3D4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LYSMD3Q7Z3D4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LYSMD3Q7Z3D4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LYSMD3Q7Z3D4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LYSMD3Q7Z3D4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LYSMD3Q7Z3D4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LYSMD3Q7Z3D4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LYSMD3Q7Z3D4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LYSMD3Q7Z3D4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LYSMD3Q7Z3D4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LYSMD3Q7Z3D4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LYSMD3Q7Z3D4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LYSMD3Q7Z3D4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LYSMD3Q7Z3D4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms