Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF111Q6ZNA4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF111Q6ZNA4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF111Q6ZNA4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF111Q6ZNA4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF111Q6ZNA4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF111Q6ZNA4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF111Q6ZNA4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF111Q6ZNA4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF111Q6ZNA4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF111Q6ZNA4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF111Q6ZNA4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF111Q6ZNA4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF111Q6ZNA4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF111Q6ZNA4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF111Q6ZNA4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF111Q6ZNA4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF111Q6ZNA4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF111Q6ZNA4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF111Q6ZNA4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF111Q6ZNA4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF111Q6ZNA4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF111Q6ZNA4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF111Q6ZNA4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF111Q6ZNA4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF111Q6ZNA4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF111Q6ZNA4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF111Q6ZNA4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF111Q6ZNA4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF111Q6ZNA4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF111Q6ZNA4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF111Q6ZNA4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF111Q6ZNA4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF111Q6ZNA4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF111Q6ZNA4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF111Q6ZNA4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF111Q6ZNA4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF111Q6ZNA4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF111Q6ZNA4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF111Q6ZNA4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF111Q6ZNA4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF111Q6ZNA4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF111Q6ZNA4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF111Q6ZNA4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF111Q6ZNA4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF111Q6ZNA4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF111Q6ZNA4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF111Q6ZNA4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF111Q6ZNA4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF111Q6ZNA4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF111Q6ZNA4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF111Q6ZNA4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF111Q6ZNA4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms