Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMCO3Q6UWJ1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMCO3Q6UWJ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMCO3Q6UWJ1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMCO3Q6UWJ1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMCO3Q6UWJ1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMCO3Q6UWJ1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMCO3Q6UWJ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMCO3Q6UWJ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMCO3Q6UWJ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMCO3Q6UWJ1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMCO3Q6UWJ1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMCO3Q6UWJ1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TMCO3Q6UWJ1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMCO3Q6UWJ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMCO3Q6UWJ1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMCO3Q6UWJ1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMCO3Q6UWJ1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMCO3Q6UWJ1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMCO3Q6UWJ1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMCO3Q6UWJ1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMCO3Q6UWJ1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMCO3Q6UWJ1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMCO3Q6UWJ1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMCO3Q6UWJ1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMCO3Q6UWJ1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TMCO3Q6UWJ1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMCO3Q6UWJ1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TMCO3Q6UWJ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TMCO3Q6UWJ1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMCO3Q6UWJ1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMCO3Q6UWJ1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMCO3Q6UWJ1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMCO3Q6UWJ1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMCO3Q6UWJ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMCO3Q6UWJ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMCO3Q6UWJ1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMCO3Q6UWJ1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMCO3Q6UWJ1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMCO3Q6UWJ1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMCO3Q6UWJ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMCO3Q6UWJ1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMCO3Q6UWJ1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMCO3Q6UWJ1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMCO3Q6UWJ1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMCO3Q6UWJ1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMCO3Q6UWJ1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMCO3Q6UWJ1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMCO3Q6UWJ1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMCO3Q6UWJ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMCO3Q6UWJ1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMCO3Q6UWJ1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMCO3Q6UWJ1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMCO3Q6UWJ1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMCO3Q6UWJ1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMCO3Q6UWJ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMCO3Q6UWJ1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMCO3Q6UWJ1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMCO3Q6UWJ1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMCO3Q6UWJ1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms