Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
APOA5Q6Q788 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
APOA5Q6Q788 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
APOA5Q6Q788 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
APOA5Q6Q788 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
APOA5Q6Q788 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
APOA5Q6Q788 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
APOA5Q6Q788 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
APOA5Q6Q788 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
APOA5Q6Q788 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
APOA5Q6Q788 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
APOA5Q6Q788 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
APOA5Q6Q788 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
APOA5Q6Q788 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
APOA5Q6Q788 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
APOA5Q6Q788 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
APOA5Q6Q788 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
APOA5Q6Q788 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
APOA5Q6Q788 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
APOA5Q6Q788 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
APOA5Q6Q788 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
APOA5Q6Q788 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
APOA5Q6Q788 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
APOA5Q6Q788 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
APOA5Q6Q788 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
APOA5Q6Q788 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
APOA5Q6Q788 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
APOA5Q6Q788 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
APOA5Q6Q788 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
APOA5Q6Q788 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
APOA5Q6Q788 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
APOA5Q6Q788 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
APOA5Q6Q788 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
APOA5Q6Q788 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
APOA5Q6Q788 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
APOA5Q6Q788 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
APOA5Q6Q788 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
APOA5Q6Q788 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
APOA5Q6Q788 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
APOA5Q6Q788 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
APOA5Q6Q788 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
APOA5Q6Q788 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
APOA5Q6Q788 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
APOA5Q6Q788 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
APOA5Q6Q788 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
APOA5Q6Q788 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
APOA5Q6Q788 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
APOA5Q6Q788 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
APOA5Q6Q788 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
APOA5Q6Q788 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
APOA5Q6Q788 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
APOA5Q6Q788 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
APOA5Q6Q788 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
APOA5Q6Q788 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
APOA5Q6Q788 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
APOA5Q6Q788 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
APOA5Q6Q788 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
APOA5Q6Q788 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
APOA5Q6Q788 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
APOA5Q6Q788 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
APOA5Q6Q788 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
APOA5Q6Q788 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
APOA5Q6Q788 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
APOA5Q6Q788 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
APOA5Q6Q788 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
APOA5Q6Q788 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
APOA5Q6Q788 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
APOA5Q6Q788 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
APOA5Q6Q788 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
APOA5Q6Q788 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
APOA5Q6Q788 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
APOA5Q6Q788 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
APOA5Q6Q788 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
APOA5Q6Q788 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
APOA5Q6Q788 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
APOA5Q6Q788 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
APOA5Q6Q788 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
APOA5Q6Q788 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
APOA5Q6Q788 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
APOA5Q6Q788 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
APOA5Q6Q788 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms