Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

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Length 78 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CSAG1Q6PB30 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CSAG1Q6PB30 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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