Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSAG1Q6PB30 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSAG1Q6PB30 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSAG1Q6PB30 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSAG1Q6PB30 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSAG1Q6PB30 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSAG1Q6PB30 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSAG1Q6PB30 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSAG1Q6PB30 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSAG1Q6PB30 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSAG1Q6PB30 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSAG1Q6PB30 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSAG1Q6PB30 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSAG1Q6PB30 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSAG1Q6PB30 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSAG1Q6PB30 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSAG1Q6PB30 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSAG1Q6PB30 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSAG1Q6PB30 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSAG1Q6PB30 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSAG1Q6PB30 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSAG1Q6PB30 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSAG1Q6PB30 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSAG1Q6PB30 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSAG1Q6PB30 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSAG1Q6PB30 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSAG1Q6PB30 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSAG1Q6PB30 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSAG1Q6PB30 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSAG1Q6PB30 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSAG1Q6PB30 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSAG1Q6PB30 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSAG1Q6PB30 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSAG1Q6PB30 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSAG1Q6PB30 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSAG1Q6PB30 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSAG1Q6PB30 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSAG1Q6PB30 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSAG1Q6PB30 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSAG1Q6PB30 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSAG1Q6PB30 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSAG1Q6PB30 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSAG1Q6PB30 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSAG1Q6PB30 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSAG1Q6PB30 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSAG1Q6PB30 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSAG1Q6PB30 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSAG1Q6PB30 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSAG1Q6PB30 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSAG1Q6PB30 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSAG1Q6PB30 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSAG1Q6PB30 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSAG1Q6PB30 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSAG1Q6PB30 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSAG1Q6PB30 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSAG1Q6PB30 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CSAG1Q6PB30 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSAG1Q6PB30 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSAG1Q6PB30 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSAG1Q6PB30 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSAG1Q6PB30 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSAG1Q6PB30 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSAG1Q6PB30 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSAG1Q6PB30 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSAG1Q6PB30 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSAG1Q6PB30 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSAG1Q6PB30 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSAG1Q6PB30 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSAG1Q6PB30 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSAG1Q6PB30 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSAG1Q6PB30 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSAG1Q6PB30 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSAG1Q6PB30 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSAG1Q6PB30 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSAG1Q6PB30 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSAG1Q6PB30 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSAG1Q6PB30 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSAG1Q6PB30 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSAG1Q6PB30 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSAG1Q6PB30 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSAG1Q6PB30 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSAG1Q6PB30 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSAG1Q6PB30 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSAG1Q6PB30 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSAG1Q6PB30 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSAG1Q6PB30 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSAG1Q6PB30 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSAG1Q6PB30 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSAG1Q6PB30 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSAG1Q6PB30 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSAG1Q6PB30 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSAG1Q6PB30 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CSAG1Q6PB30 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CSAG1Q6PB30 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSAG1Q6PB30 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSAG1Q6PB30 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSAG1Q6PB30 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSAG1Q6PB30 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSAG1Q6PB30 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSAG1Q6PB30 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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