Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRGCQ6NXR0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IRGCQ6NXR0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IRGCQ6NXR0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
IRGCQ6NXR0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRGCQ6NXR0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRGCQ6NXR0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRGCQ6NXR0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRGCQ6NXR0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRGCQ6NXR0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRGCQ6NXR0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRGCQ6NXR0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRGCQ6NXR0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRGCQ6NXR0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
IRGCQ6NXR0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRGCQ6NXR0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IRGCQ6NXR0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IRGCQ6NXR0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IRGCQ6NXR0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRGCQ6NXR0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRGCQ6NXR0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRGCQ6NXR0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRGCQ6NXR0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRGCQ6NXR0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRGCQ6NXR0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRGCQ6NXR0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRGCQ6NXR0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRGCQ6NXR0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRGCQ6NXR0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRGCQ6NXR0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRGCQ6NXR0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRGCQ6NXR0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRGCQ6NXR0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRGCQ6NXR0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRGCQ6NXR0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRGCQ6NXR0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRGCQ6NXR0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRGCQ6NXR0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms