Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
IRGCQ6NXR0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
IRGCQ6NXR0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
IRGCQ6NXR0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
IRGCQ6NXR0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
IRGCQ6NXR0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
IRGCQ6NXR0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
IRGCQ6NXR0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
IRGCQ6NXR0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
IRGCQ6NXR0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
IRGCQ6NXR0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
IRGCQ6NXR0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
IRGCQ6NXR0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
IRGCQ6NXR0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
IRGCQ6NXR0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
IRGCQ6NXR0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
IRGCQ6NXR0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
IRGCQ6NXR0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
IRGCQ6NXR0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
IRGCQ6NXR0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
IRGCQ6NXR0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IRGCQ6NXR0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
IRGCQ6NXR0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
IRGCQ6NXR0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
IRGCQ6NXR0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
IRGCQ6NXR0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
IRGCQ6NXR0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
IRGCQ6NXR0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
IRGCQ6NXR0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
IRGCQ6NXR0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
IRGCQ6NXR0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
IRGCQ6NXR0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
IRGCQ6NXR0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
IRGCQ6NXR0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
IRGCQ6NXR0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRGCQ6NXR0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IRGCQ6NXR0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IRGCQ6NXR0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IRGCQ6NXR0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IRGCQ6NXR0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IRGCQ6NXR0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IRGCQ6NXR0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IRGCQ6NXR0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IRGCQ6NXR0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IRGCQ6NXR0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
IRGCQ6NXR0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IRGCQ6NXR0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IRGCQ6NXR0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRGCQ6NXR0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IRGCQ6NXR0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IRGCQ6NXR0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRGCQ6NXR0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRGCQ6NXR0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRGCQ6NXR0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRGCQ6NXR0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRGCQ6NXR0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRGCQ6NXR0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRGCQ6NXR0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IRGCQ6NXR0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IRGCQ6NXR0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
IRGCQ6NXR0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IRGCQ6NXR0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IRGCQ6NXR0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IRGCQ6NXR0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRGCQ6NXR0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRGCQ6NXR0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IRGCQ6NXR0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IRGCQ6NXR0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IRGCQ6NXR0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IRGCQ6NXR0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
IRGCQ6NXR0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IRGCQ6NXR0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRGCQ6NXR0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRGCQ6NXR0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
IRGCQ6NXR0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRGCQ6NXR0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRGCQ6NXR0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRGCQ6NXR0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IRGCQ6NXR0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRGCQ6NXR0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRGCQ6NXR0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IRGCQ6NXR0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IRGCQ6NXR0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IRGCQ6NXR0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRGCQ6NXR0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRGCQ6NXR0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRGCQ6NXR0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRGCQ6NXR0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRGCQ6NXR0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRGCQ6NXR0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRGCQ6NXR0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IRGCQ6NXR0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IRGCQ6NXR0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRGCQ6NXR0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRGCQ6NXR0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRGCQ6NXR0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRGCQ6NXR0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRGCQ6NXR0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRGCQ6NXR0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRGCQ6NXR0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms