Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB12Q6IQ22 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB12Q6IQ22 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB12Q6IQ22 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB12Q6IQ22 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB12Q6IQ22 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB12Q6IQ22 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB12Q6IQ22 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB12Q6IQ22 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB12Q6IQ22 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB12Q6IQ22 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB12Q6IQ22 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB12Q6IQ22 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB12Q6IQ22 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB12Q6IQ22 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB12Q6IQ22 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB12Q6IQ22 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB12Q6IQ22 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB12Q6IQ22 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB12Q6IQ22 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB12Q6IQ22 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB12Q6IQ22 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB12Q6IQ22 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB12Q6IQ22 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB12Q6IQ22 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB12Q6IQ22 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB12Q6IQ22 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB12Q6IQ22 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB12Q6IQ22 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB12Q6IQ22 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB12Q6IQ22 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB12Q6IQ22 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB12Q6IQ22 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB12Q6IQ22 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB12Q6IQ22 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB12Q6IQ22 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB12Q6IQ22 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB12Q6IQ22 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB12Q6IQ22 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB12Q6IQ22 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB12Q6IQ22 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB12Q6IQ22 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB12Q6IQ22 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB12Q6IQ22 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB12Q6IQ22 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB12Q6IQ22 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB12Q6IQ22 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB12Q6IQ22 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB12Q6IQ22 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB12Q6IQ22 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms