Protein–RNA interactions for Protein: Q6GPI1

CTRB2, Chymotrypsinogen B2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB2Q6GPI1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTRB2Q6GPI1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTRB2Q6GPI1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTRB2Q6GPI1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTRB2Q6GPI1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTRB2Q6GPI1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTRB2Q6GPI1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTRB2Q6GPI1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTRB2Q6GPI1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRB2Q6GPI1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRB2Q6GPI1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRB2Q6GPI1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRB2Q6GPI1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTRB2Q6GPI1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTRB2Q6GPI1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRB2Q6GPI1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRB2Q6GPI1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRB2Q6GPI1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRB2Q6GPI1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRB2Q6GPI1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRB2Q6GPI1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRB2Q6GPI1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms