Protein–RNA interactions for Protein: Q63HQ0

AP1AR, AP-1 complex-associated regulatory protein, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1ARQ63HQ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AP1ARQ63HQ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP1ARQ63HQ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP1ARQ63HQ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP1ARQ63HQ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP1ARQ63HQ0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP1ARQ63HQ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP1ARQ63HQ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP1ARQ63HQ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP1ARQ63HQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1ARQ63HQ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1ARQ63HQ0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1ARQ63HQ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1ARQ63HQ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1ARQ63HQ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1ARQ63HQ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP1ARQ63HQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP1ARQ63HQ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP1ARQ63HQ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AP1ARQ63HQ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP1ARQ63HQ0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP1ARQ63HQ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP1ARQ63HQ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP1ARQ63HQ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP1ARQ63HQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP1ARQ63HQ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP1ARQ63HQ0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP1ARQ63HQ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP1ARQ63HQ0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP1ARQ63HQ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP1ARQ63HQ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP1ARQ63HQ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP1ARQ63HQ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP1ARQ63HQ0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AP1ARQ63HQ0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP1ARQ63HQ0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP1ARQ63HQ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP1ARQ63HQ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP1ARQ63HQ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP1ARQ63HQ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms