Protein–RNA interactions for Protein: Q5Y7H0

HLA-DQA1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA1Q5Y7H0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DQA1Q5Y7H0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DQA1Q5Y7H0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DQA1Q5Y7H0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DQA1Q5Y7H0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DQA1Q5Y7H0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DQA1Q5Y7H0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DQA1Q5Y7H0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DQA1Q5Y7H0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DQA1Q5Y7H0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DQA1Q5Y7H0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DQA1Q5Y7H0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DQA1Q5Y7H0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DQA1Q5Y7H0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DQA1Q5Y7H0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DQA1Q5Y7H0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DQA1Q5Y7H0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DQA1Q5Y7H0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DQA1Q5Y7H0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-DQA1Q5Y7H0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-DQA1Q5Y7H0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-DQA1Q5Y7H0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-DQA1Q5Y7H0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DQA1Q5Y7H0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-DQA1Q5Y7H0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-DQA1Q5Y7H0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-DQA1Q5Y7H0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-DQA1Q5Y7H0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-DQA1Q5Y7H0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DQA1Q5Y7H0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DQA1Q5Y7H0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DQA1Q5Y7H0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DQA1Q5Y7H0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DQA1Q5Y7H0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DQA1Q5Y7H0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DQA1Q5Y7H0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DQA1Q5Y7H0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DQA1Q5Y7H0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DQA1Q5Y7H0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DQA1Q5Y7H0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DQA1Q5Y7H0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DQA1Q5Y7H0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DQA1Q5Y7H0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DQA1Q5Y7H0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-DQA1Q5Y7H0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms