Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF220Q5VTB9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF220Q5VTB9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF220Q5VTB9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF220Q5VTB9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF220Q5VTB9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF220Q5VTB9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF220Q5VTB9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF220Q5VTB9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF220Q5VTB9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF220Q5VTB9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF220Q5VTB9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF220Q5VTB9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF220Q5VTB9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF220Q5VTB9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF220Q5VTB9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF220Q5VTB9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF220Q5VTB9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF220Q5VTB9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF220Q5VTB9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF220Q5VTB9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF220Q5VTB9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF220Q5VTB9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF220Q5VTB9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF220Q5VTB9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF220Q5VTB9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF220Q5VTB9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF220Q5VTB9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF220Q5VTB9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF220Q5VTB9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF220Q5VTB9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF220Q5VTB9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF220Q5VTB9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF220Q5VTB9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF220Q5VTB9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF220Q5VTB9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF220Q5VTB9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF220Q5VTB9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF220Q5VTB9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF220Q5VTB9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF220Q5VTB9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF220Q5VTB9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF220Q5VTB9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF220Q5VTB9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms