Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSZ5

PRRC2B, Protein PRRC2B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC2BQ5JSZ5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRRC2BQ5JSZ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRRC2BQ5JSZ5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRRC2BQ5JSZ5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRRC2BQ5JSZ5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRRC2BQ5JSZ5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRRC2BQ5JSZ5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRRC2BQ5JSZ5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRRC2BQ5JSZ5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRRC2BQ5JSZ5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRRC2BQ5JSZ5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRRC2BQ5JSZ5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRRC2BQ5JSZ5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRRC2BQ5JSZ5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRRC2BQ5JSZ5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRRC2BQ5JSZ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRRC2BQ5JSZ5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRRC2BQ5JSZ5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRRC2BQ5JSZ5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRRC2BQ5JSZ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRRC2BQ5JSZ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRRC2BQ5JSZ5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRRC2BQ5JSZ5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PRRC2BQ5JSZ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRRC2BQ5JSZ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRRC2BQ5JSZ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRRC2BQ5JSZ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRRC2BQ5JSZ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRRC2BQ5JSZ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRRC2BQ5JSZ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRRC2BQ5JSZ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRRC2BQ5JSZ5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRRC2BQ5JSZ5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRRC2BQ5JSZ5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRRC2BQ5JSZ5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRRC2BQ5JSZ5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRRC2BQ5JSZ5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRRC2BQ5JSZ5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRRC2BQ5JSZ5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRRC2BQ5JSZ5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRRC2BQ5JSZ5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRRC2BQ5JSZ5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRRC2BQ5JSZ5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRRC2BQ5JSZ5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRRC2BQ5JSZ5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRRC2BQ5JSZ5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRRC2BQ5JSZ5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRRC2BQ5JSZ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRRC2BQ5JSZ5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRRC2BQ5JSZ5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRRC2BQ5JSZ5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRRC2BQ5JSZ5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRRC2BQ5JSZ5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRRC2BQ5JSZ5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRRC2BQ5JSZ5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRRC2BQ5JSZ5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRRC2BQ5JSZ5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRRC2BQ5JSZ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRRC2BQ5JSZ5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRRC2BQ5JSZ5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRRC2BQ5JSZ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRRC2BQ5JSZ5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRRC2BQ5JSZ5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRRC2BQ5JSZ5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRRC2BQ5JSZ5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRRC2BQ5JSZ5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRRC2BQ5JSZ5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRRC2BQ5JSZ5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRRC2BQ5JSZ5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRRC2BQ5JSZ5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRRC2BQ5JSZ5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PRRC2BQ5JSZ5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRRC2BQ5JSZ5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRRC2BQ5JSZ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRRC2BQ5JSZ5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRRC2BQ5JSZ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRRC2BQ5JSZ5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRRC2BQ5JSZ5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRRC2BQ5JSZ5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRRC2BQ5JSZ5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRRC2BQ5JSZ5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms