Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WDR44Q5JSH3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WDR44Q5JSH3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
WDR44Q5JSH3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WDR44Q5JSH3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
WDR44Q5JSH3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
WDR44Q5JSH3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
WDR44Q5JSH3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR44Q5JSH3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR44Q5JSH3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
WDR44Q5JSH3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WDR44Q5JSH3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WDR44Q5JSH3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
WDR44Q5JSH3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR44Q5JSH3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR44Q5JSH3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR44Q5JSH3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
WDR44Q5JSH3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
WDR44Q5JSH3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
WDR44Q5JSH3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
WDR44Q5JSH3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
WDR44Q5JSH3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
WDR44Q5JSH3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
WDR44Q5JSH3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR44Q5JSH3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR44Q5JSH3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR44Q5JSH3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR44Q5JSH3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR44Q5JSH3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR44Q5JSH3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR44Q5JSH3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR44Q5JSH3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR44Q5JSH3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR44Q5JSH3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR44Q5JSH3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR44Q5JSH3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR44Q5JSH3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
WDR44Q5JSH3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
WDR44Q5JSH3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
WDR44Q5JSH3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
WDR44Q5JSH3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
WDR44Q5JSH3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
WDR44Q5JSH3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
WDR44Q5JSH3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR44Q5JSH3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR44Q5JSH3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR44Q5JSH3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR44Q5JSH3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WDR44Q5JSH3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WDR44Q5JSH3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WDR44Q5JSH3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
WDR44Q5JSH3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WDR44Q5JSH3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
WDR44Q5JSH3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
WDR44Q5JSH3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms