Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0J3

LARP7, La-related protein 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP7Q4G0J3 SRSF5-212ENST00000556184 2443 ntTSL 1 (best)11.03□□□□□ -0.647e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-211ENST00000555547 2057 ntTSL 510.97□□□□□ -0.657e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-217ENST00000557154 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.857e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-202ENST00000553369 613 ntTSL 29.43□□□□□ -0.97e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-204ENST00000553548 526 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.97e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-207ENST00000554465 3044 ntTSL 1 (best)8.91□□□□□ -0.987e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-219ENST00000557460 939 ntTSL 58.66□□□□□ -1.027e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-206ENST00000554021 567 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.147e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.317e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.578e-13■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC4.54□□□□□ -1.682e-18■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 PRPF39-206ENST00000554429 2977 ntTSL 53.09□□□□□ -1.912e-18■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 PRPF39-207ENST00000554439 2982 ntTSL 53.01□□□□□ -1.932e-18■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 PRPF39-208ENST00000554785 2121 ntTSL 22.67□□□□□ -1.982e-18■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 PRPF39-205ENST00000554081 3223 ntTSL 52.39□□□□□ -2.032e-18■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.418e-7■■■■■ 40.8
LARP7Q4G0J3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.068e-7■■■■■ 40.8
LARP7Q4G0J3 UBAP2-212ENST00000629575 3460 ntTSL 28.23□□□□□ -1.093e-11■■■■■ 40.8
LARP7Q4G0J3 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.123e-11■■■■■ 40.8
LARP7Q4G0J3 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.123e-11■■■■■ 40.8
LARP7Q4G0J3 ATP5B-203ENST00000547808 705 ntTSL 518.6■□□□□ 0.571e-8■■■■■ 40.3
LARP7Q4G0J3 ATP5B-210ENST00000552959 1085 ntTSL 318.42■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 40.3
LARP7Q4G0J3 ATP5B-211ENST00000553007 814 ntTSL 518.3■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 40.3
LARP7Q4G0J3 ATP5B-207ENST00000551020 856 ntTSL 318.3■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 40.3
LARP7Q4G0J3 ATP5B-205ENST00000548647 682 ntTSL 515.49■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 40.3
LARP7Q4G0J3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.061e-8■■■■■ 40.3
LARP7Q4G0J3 ATP5B-204ENST00000548474 449 ntTSL 36.02□□□□□ -1.451e-8■■■■■ 40.3
LARP7Q4G0J3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.484e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ITPKA-203ENST00000462816 854 ntTSL 318.22■□□□□ 0.514e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.484e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PES1-212ENST00000488719 1732 ntTSL 217.43■□□□□ 0.384e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ITPKA-202ENST00000425927 852 ntTSL 517.13■□□□□ 0.334e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 AAMDC-205ENST00000526164 726 ntTSL 215.37■□□□□ 0.054e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 04e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PES1-208ENST00000441668 999 ntTSL 314.43□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ITPKA-204ENST00000491007 507 ntTSL 313.44□□□□□ -0.264e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.284e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.374e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PPARD-204ENST00000418635 3453 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.44e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.414e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.414e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PPARD-203ENST00000360694 3747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.434e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.484e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PPARD-201ENST00000311565 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.644e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 AAMDC-201ENST00000304716 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.74e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 AAMDC-212ENST00000630098 542 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.754e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 AAMDC-208ENST00000529666 440 ntTSL 36.51□□□□□ -1.374e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-217ENST00000638952 5678 ntTSL 518.83■□□□□ 0.67e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 AHNAK-208ENST00000533365 584 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.49■□□□□ 0.557e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.497e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.477e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.417e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 ATF5-203ENST00000596658 722 ntTSL 217.56■□□□□ 0.47e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-209ENST00000476241 4844 ntTSL 517.08■□□□□ 0.327e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-228ENST00000640306 2917 ntTSL 516.83■□□□□ 0.287e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.157e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.127e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.117e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-214ENST00000638475 2698 ntTSL 515.77■□□□□ 0.117e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.037e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.087e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-229ENST00000640440 871 ntTSL 314.03□□□□□ -0.167e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.187e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.197e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 PLEKHA7-211ENST00000531066 4561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.447e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 STK3-217ENST00000523960 5333 ntTSL 1 (best)12.01□□□□□ -0.497e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 STK3-207ENST00000519420 531 ntTSL 411.9□□□□□ -0.57e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP20-201ENST00000362752 313 ntBASIC11.57□□□□□ -0.567e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 PLEKHA7-209ENST00000529213 561 ntTSL 411.27□□□□□ -0.617e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-224ENST00000640056 2045 ntTSL 510.28□□□□□ -0.767e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP87-201ENST00000364096 301 ntBASIC8.96□□□□□ -0.987e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP10-201ENST00000364291 325 ntBASIC8.33□□□□□ -1.087e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC7.54□□□□□ -1.27e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.47e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.547e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 RPL4-204ENST00000563473 475 ntTSL 36.7□□□□□ -1.341e-323■■■■■ 37.4
LARP7Q4G0J3 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.631e-323■■■■■ 37.4
LARP7Q4G0J3 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.986e-6■■■■■ 37.3
LARP7Q4G0J3 LINC00687-202ENST00000557899 490 ntTSL 28.52□□□□□ -1.056e-6■■■■■ 37.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.35□□□□□ -1.876e-6■■■■■ 37.3
LARP7Q4G0J3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 37
LARP7Q4G0J3 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 37
LARP7Q4G0J3 SELENOP-214ENST00000514985 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 37
LARP7Q4G0J3 SELENOP-210ENST00000512980 4175 ntTSL 26.95□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 37
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-204ENST00000461653 1702 ntTSL 57.91□□□□□ -1.141e-323■■■■■ 36.9
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-211ENST00000489450 586 ntTSL 55.6□□□□□ -1.511e-323■■■■■ 36.9
LARP7Q4G0J3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.844e-6■■■■■ 36.7
LARP7Q4G0J3 TH2LCRR-204ENST00000458509 407 ntTSL 1 (best)21.47■■□□□ 1.034e-6■■■■■ 36.7
LARP7Q4G0J3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 14e-6■■■■■ 36.7
LARP7Q4G0J3 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.684e-6■■■■■ 36.7
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