Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0J3

LARP7, La-related protein 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP7Q4G0J3 SRSF5-212ENST00000556184 2443 ntTSL 1 (best)11.03□□□□□ -0.647e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-211ENST00000555547 2057 ntTSL 510.97□□□□□ -0.657e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-217ENST00000557154 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.857e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-202ENST00000553369 613 ntTSL 29.43□□□□□ -0.97e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-204ENST00000553548 526 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.97e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-207ENST00000554465 3044 ntTSL 1 (best)8.91□□□□□ -0.987e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-219ENST00000557460 939 ntTSL 58.66□□□□□ -1.027e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-206ENST00000554021 567 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.147e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.317e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.578e-13■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC4.54□□□□□ -1.682e-18■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 PRPF39-206ENST00000554429 2977 ntTSL 53.09□□□□□ -1.912e-18■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 PRPF39-207ENST00000554439 2982 ntTSL 53.01□□□□□ -1.932e-18■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 PRPF39-208ENST00000554785 2121 ntTSL 22.67□□□□□ -1.982e-18■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 PRPF39-205ENST00000554081 3223 ntTSL 52.39□□□□□ -2.032e-18■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.418e-7■■■■■ 40.8
LARP7Q4G0J3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.068e-7■■■■■ 40.8
LARP7Q4G0J3 UBAP2-212ENST00000629575 3460 ntTSL 28.23□□□□□ -1.093e-11■■■■■ 40.8
LARP7Q4G0J3 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.123e-11■■■■■ 40.8
LARP7Q4G0J3 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.123e-11■■■■■ 40.8
LARP7Q4G0J3 ATP5B-203ENST00000547808 705 ntTSL 518.6■□□□□ 0.571e-8■■■■■ 40.3
LARP7Q4G0J3 ATP5B-210ENST00000552959 1085 ntTSL 318.42■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 40.3
LARP7Q4G0J3 ATP5B-211ENST00000553007 814 ntTSL 518.3■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 40.3
LARP7Q4G0J3 ATP5B-207ENST00000551020 856 ntTSL 318.3■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 40.3
LARP7Q4G0J3 ATP5B-205ENST00000548647 682 ntTSL 515.49■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 40.3
LARP7Q4G0J3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.061e-8■■■■■ 40.3
LARP7Q4G0J3 ATP5B-204ENST00000548474 449 ntTSL 36.02□□□□□ -1.451e-8■■■■■ 40.3
LARP7Q4G0J3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.484e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ITPKA-203ENST00000462816 854 ntTSL 318.22■□□□□ 0.514e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.484e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PES1-212ENST00000488719 1732 ntTSL 217.43■□□□□ 0.384e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ITPKA-202ENST00000425927 852 ntTSL 517.13■□□□□ 0.334e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 AAMDC-205ENST00000526164 726 ntTSL 215.37■□□□□ 0.054e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 04e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PES1-208ENST00000441668 999 ntTSL 314.43□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ITPKA-204ENST00000491007 507 ntTSL 313.44□□□□□ -0.264e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.284e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.374e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PPARD-204ENST00000418635 3453 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.44e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.414e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.414e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PPARD-203ENST00000360694 3747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.434e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.484e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 PPARD-201ENST00000311565 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.644e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 AAMDC-201ENST00000304716 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.74e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 AAMDC-212ENST00000630098 542 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.754e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 AAMDC-208ENST00000529666 440 ntTSL 36.51□□□□□ -1.374e-6■■■■■ 38.1
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-217ENST00000638952 5678 ntTSL 518.83■□□□□ 0.67e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 AHNAK-208ENST00000533365 584 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.49■□□□□ 0.557e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.497e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.477e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.417e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 ATF5-203ENST00000596658 722 ntTSL 217.56■□□□□ 0.47e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-209ENST00000476241 4844 ntTSL 517.08■□□□□ 0.327e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-228ENST00000640306 2917 ntTSL 516.83■□□□□ 0.287e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.157e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.127e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.117e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-214ENST00000638475 2698 ntTSL 515.77■□□□□ 0.117e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.037e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.087e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-229ENST00000640440 871 ntTSL 314.03□□□□□ -0.167e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.187e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.197e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 PLEKHA7-211ENST00000531066 4561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.447e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 STK3-217ENST00000523960 5333 ntTSL 1 (best)12.01□□□□□ -0.497e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 STK3-207ENST00000519420 531 ntTSL 411.9□□□□□ -0.57e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP20-201ENST00000362752 313 ntBASIC11.57□□□□□ -0.567e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 PLEKHA7-209ENST00000529213 561 ntTSL 411.27□□□□□ -0.617e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 HNRNPU-224ENST00000640056 2045 ntTSL 510.28□□□□□ -0.767e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP87-201ENST00000364096 301 ntBASIC8.96□□□□□ -0.987e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP10-201ENST00000364291 325 ntBASIC8.33□□□□□ -1.087e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC7.54□□□□□ -1.27e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.47e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.547e-6■■■■■ 37.6
LARP7Q4G0J3 RPL4-204ENST00000563473 475 ntTSL 36.7□□□□□ -1.341e-323■■■■■ 37.4
LARP7Q4G0J3 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.631e-323■■■■■ 37.4
LARP7Q4G0J3 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.986e-6■■■■■ 37.3
LARP7Q4G0J3 LINC00687-202ENST00000557899 490 ntTSL 28.52□□□□□ -1.056e-6■■■■■ 37.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.35□□□□□ -1.876e-6■■■■■ 37.3
LARP7Q4G0J3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 37
LARP7Q4G0J3 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 37
LARP7Q4G0J3 SELENOP-214ENST00000514985 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 37
LARP7Q4G0J3 SELENOP-210ENST00000512980 4175 ntTSL 26.95□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 37
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-204ENST00000461653 1702 ntTSL 57.91□□□□□ -1.141e-323■■■■■ 36.9
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-211ENST00000489450 586 ntTSL 55.6□□□□□ -1.511e-323■■■■■ 36.9
LARP7Q4G0J3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.844e-6■■■■■ 36.7
LARP7Q4G0J3 TH2LCRR-204ENST00000458509 407 ntTSL 1 (best)21.47■■□□□ 1.034e-6■■■■■ 36.7
LARP7Q4G0J3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 14e-6■■■■■ 36.7
LARP7Q4G0J3 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.684e-6■■■■■ 36.7
Retrieved 100 of 2,094 protein–RNA pairs in 18.5 ms