RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362752.1

RN7SKP20-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 20, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP20, Length 313 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP20-201ENST00000362752 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.49■■■□□ 2.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.11■■□□□ 1.61
RN7SKP20-201ENST00000362752 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
RN7SKP20-201ENST00000362752 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.72■■□□□ 1.39
RN7SKP20-201ENST00000362752 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.54■■□□□ 1.36
RN7SKP20-201ENST00000362752 ABCC9O60706 1549 aa23.53■■□□□ 1.36
RN7SKP20-201ENST00000362752 NACADO15069 1562 aa23.35■■□□□ 1.33
RN7SKP20-201ENST00000362752 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.21■■□□□ 1.31
RN7SKP20-201ENST00000362752 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.15■■□□□ 1.3
RN7SKP20-201ENST00000362752 SCRIBQ14160 1630 aa22.8■■□□□ 1.24
RN7SKP20-201ENST00000362752 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.79■■□□□ 1.24
RN7SKP20-201ENST00000362752 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.68■■□□□ 1.22
RN7SKP20-201ENST00000362752 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.38■■□□□ 1.17
RN7SKP20-201ENST00000362752 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RN7SKP20-201ENST00000362752 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
RN7SKP20-201ENST00000362752 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.01■■□□□ 1.11
RN7SKP20-201ENST00000362752 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
RN7SKP20-201ENST00000362752 SMARCA4P51532 1647 aa21.96■■□□□ 1.11
RN7SKP20-201ENST00000362752 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.92■■□□□ 1.1
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RN7SKP20-201ENST00000362752 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.8■■□□□ 1.08
RN7SKP20-201ENST00000362752 WIZO95785 1651 aa21.75■■□□□ 1.07
RN7SKP20-201ENST00000362752 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
RN7SKP20-201ENST00000362752 SMARCA2P51531 1590 aa21.67■■□□□ 1.06
RN7SKP20-201ENST00000362752 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
RN7SKP20-201ENST00000362752 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.58■■□□□ 1.04
RN7SKP20-201ENST00000362752 HMGXB3Q12766 1538 aa21.51■■□□□ 1.03
RN7SKP20-201ENST00000362752 NCAPD3P42695 1498 aa21.48■■□□□ 1.03
RN7SKP20-201ENST00000362752 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
RN7SKP20-201ENST00000362752 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.41■■□□□ 1.02
RN7SKP20-201ENST00000362752 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.28■■□□□ 1
RN7SKP20-201ENST00000362752 PRDM2Q13029 1718 aa21.01■□□□□ 0.95
RN7SKP20-201ENST00000362752 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.96■□□□□ 0.95
RN7SKP20-201ENST00000362752 CFTRP13569 1480 aa20.94■□□□□ 0.94
RN7SKP20-201ENST00000362752 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.85■□□□□ 0.93
RN7SKP20-201ENST00000362752 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.84■□□□□ 0.93
RN7SKP20-201ENST00000362752 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.75■□□□□ 0.91
RN7SKP20-201ENST00000362752 ABCC8Q09428 1581 aa20.73■□□□□ 0.91
RN7SKP20-201ENST00000362752 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.9
RN7SKP20-201ENST00000362752 TRIM41Q8WV44 630 aa20.69■□□□□ 0.9
RN7SKP20-201ENST00000362752 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.67■□□□□ 0.9
RN7SKP20-201ENST00000362752 TOP2BQ02880 1626 aa20.64■□□□□ 0.9
RN7SKP20-201ENST00000362752 SYNJ1O43426 1573 aa20.62■□□□□ 0.89
RN7SKP20-201ENST00000362752 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.62■□□□□ 0.89
RN7SKP20-201ENST00000362752 NESP48681 1621 aa20.6■□□□□ 0.89
RN7SKP20-201ENST00000362752 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.6■□□□□ 0.89
RN7SKP20-201ENST00000362752 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.54■□□□□ 0.88
RN7SKP20-201ENST00000362752 CUX1P39880 1505 aa20.53■□□□□ 0.88
RN7SKP20-201ENST00000362752 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.51■□□□□ 0.87
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RN7SKP20-201ENST00000362752 EEA1Q15075 1411 aa20.45■□□□□ 0.86
RN7SKP20-201ENST00000362752 TOPBP1Q92547 1522 aa20.39■□□□□ 0.85
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RN7SKP20-201ENST00000362752 ERCC6Q03468 1493 aa20.25■□□□□ 0.83
RN7SKP20-201ENST00000362752 WDR97A6NE52 1622 aa20.24■□□□□ 0.83
RN7SKP20-201ENST00000362752 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.22■□□□□ 0.83
RN7SKP20-201ENST00000362752 KIF27Q86VH2 1401 aa20.21■□□□□ 0.83
RN7SKP20-201ENST00000362752 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.18■□□□□ 0.82
RN7SKP20-201ENST00000362752 KIF21BO75037 1637 aa20.18■□□□□ 0.82
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RN7SKP20-201ENST00000362752 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.15■□□□□ 0.82
RN7SKP20-201ENST00000362752 CUX2O14529 1486 aa20.13■□□□□ 0.81
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RN7SKP20-201ENST00000362752 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.1■□□□□ 0.81
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RN7SKP20-201ENST00000362752 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.09■□□□□ 0.81
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RN7SKP20-201ENST00000362752 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.95■□□□□ 0.79
RN7SKP20-201ENST00000362752 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.92■□□□□ 0.78
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RN7SKP20-201ENST00000362752 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.81■□□□□ 0.76
RN7SKP20-201ENST00000362752 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.79■□□□□ 0.76
RN7SKP20-201ENST00000362752 UBTFP17480 764 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
RN7SKP20-201ENST00000362752 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.78■□□□□ 0.76
RN7SKP20-201ENST00000362752 CEP162Q5TB80 1403 aa19.78■□□□□ 0.76
RN7SKP20-201ENST00000362752 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
RN7SKP20-201ENST00000362752 EHMT2Q96KQ7 1210 aa19.71■□□□□ 0.75
RN7SKP20-201ENST00000362752 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.7■□□□□ 0.74
RN7SKP20-201ENST00000362752 CLIP1P30622 1438 aa19.68■□□□□ 0.74
RN7SKP20-201ENST00000362752 SYNJ2O15056 1496 aa19.67■□□□□ 0.74
RN7SKP20-201ENST00000362752 GRIN2AQ12879 1464 aa19.63■□□□□ 0.73
RN7SKP20-201ENST00000362752 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.61■□□□□ 0.73
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