Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PKN1Q16512 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PKN1Q16512 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PKN1Q16512 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PKN1Q16512 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PKN1Q16512 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PKN1Q16512 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PKN1Q16512 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PKN1Q16512 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PKN1Q16512 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PKN1Q16512 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PKN1Q16512 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PKN1Q16512 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PKN1Q16512 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PKN1Q16512 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PKN1Q16512 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PKN1Q16512 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PKN1Q16512 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PKN1Q16512 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PKN1Q16512 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PKN1Q16512 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKN1Q16512 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PKN1Q16512 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PKN1Q16512 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PKN1Q16512 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PKN1Q16512 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PKN1Q16512 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PKN1Q16512 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PKN1Q16512 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PKN1Q16512 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PKN1Q16512 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PKN1Q16512 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PKN1Q16512 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PKN1Q16512 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PKN1Q16512 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PKN1Q16512 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PKN1Q16512 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PKN1Q16512 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PKN1Q16512 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PKN1Q16512 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PKN1Q16512 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PKN1Q16512 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKN1Q16512 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKN1Q16512 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKN1Q16512 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKN1Q16512 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKN1Q16512 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKN1Q16512 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PKN1Q16512 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKN1Q16512 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PKN1Q16512 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PKN1Q16512 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PKN1Q16512 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PKN1Q16512 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PKN1Q16512 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PKN1Q16512 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
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