Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MDC1Q14676 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MDC1Q14676 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MDC1Q14676 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MDC1Q14676 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDC1Q14676 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDC1Q14676 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDC1Q14676 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDC1Q14676 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDC1Q14676 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MDC1Q14676 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDC1Q14676 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MDC1Q14676 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDC1Q14676 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MDC1Q14676 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MDC1Q14676 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MDC1Q14676 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MDC1Q14676 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MDC1Q14676 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MDC1Q14676 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
MDC1Q14676 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDC1Q14676 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MDC1Q14676 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDC1Q14676 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDC1Q14676 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDC1Q14676 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDC1Q14676 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDC1Q14676 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDC1Q14676 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDC1Q14676 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDC1Q14676 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDC1Q14676 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDC1Q14676 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MDC1Q14676 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDC1Q14676 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MDC1Q14676 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MDC1Q14676 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDC1Q14676 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDC1Q14676 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDC1Q14676 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDC1Q14676 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDC1Q14676 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDC1Q14676 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDC1Q14676 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDC1Q14676 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDC1Q14676 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDC1Q14676 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDC1Q14676 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDC1Q14676 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDC1Q14676 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDC1Q14676 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDC1Q14676 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDC1Q14676 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDC1Q14676 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDC1Q14676 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDC1Q14676 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDC1Q14676 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDC1Q14676 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDC1Q14676 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDC1Q14676 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDC1Q14676 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
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