Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTAN1Q13813 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTAN1Q13813 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTAN1Q13813 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTAN1Q13813 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTAN1Q13813 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTAN1Q13813 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTAN1Q13813 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTAN1Q13813 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTAN1Q13813 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTAN1Q13813 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTAN1Q13813 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPTAN1Q13813 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTAN1Q13813 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTAN1Q13813 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTAN1Q13813 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTAN1Q13813 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTAN1Q13813 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTAN1Q13813 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTAN1Q13813 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTAN1Q13813 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTAN1Q13813 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTAN1Q13813 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTAN1Q13813 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPTAN1Q13813 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPTAN1Q13813 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTAN1Q13813 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPTAN1Q13813 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPTAN1Q13813 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTAN1Q13813 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTAN1Q13813 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTAN1Q13813 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTAN1Q13813 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTAN1Q13813 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTAN1Q13813 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTAN1Q13813 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTAN1Q13813 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTAN1Q13813 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTAN1Q13813 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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