Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAMK2DQ13557 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAMK2DQ13557 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAMK2DQ13557 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAMK2DQ13557 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMK2DQ13557 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMK2DQ13557 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMK2DQ13557 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMK2DQ13557 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMK2DQ13557 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMK2DQ13557 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMK2DQ13557 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMK2DQ13557 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMK2DQ13557 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMK2DQ13557 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMK2DQ13557 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMK2DQ13557 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMK2DQ13557 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMK2DQ13557 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMK2DQ13557 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMK2DQ13557 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMK2DQ13557 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMK2DQ13557 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMK2DQ13557 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMK2DQ13557 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMK2DQ13557 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMK2DQ13557 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMK2DQ13557 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMK2DQ13557 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAMK2DQ13557 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAMK2DQ13557 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAMK2DQ13557 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAMK2DQ13557 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAMK2DQ13557 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAMK2DQ13557 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAMK2DQ13557 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAMK2DQ13557 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAMK2DQ13557 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMK2DQ13557 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMK2DQ13557 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAMK2DQ13557 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAMK2DQ13557 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAMK2DQ13557 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAMK2DQ13557 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAMK2DQ13557 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAMK2DQ13557 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAMK2DQ13557 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAMK2DQ13557 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAMK2DQ13557 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAMK2DQ13557 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CAMK2DQ13557 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAMK2DQ13557 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAMK2DQ13557 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAMK2DQ13557 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAMK2DQ13557 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAMK2DQ13557 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAMK2DQ13557 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAMK2DQ13557 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAMK2DQ13557 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAMK2DQ13557 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAMK2DQ13557 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAMK2DQ13557 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAMK2DQ13557 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAMK2DQ13557 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAMK2DQ13557 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAMK2DQ13557 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAMK2DQ13557 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAMK2DQ13557 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAMK2DQ13557 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAMK2DQ13557 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAMK2DQ13557 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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