Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPA4Q13156 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPA4Q13156 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPA4Q13156 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPA4Q13156 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPA4Q13156 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPA4Q13156 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPA4Q13156 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPA4Q13156 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPA4Q13156 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPA4Q13156 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPA4Q13156 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPA4Q13156 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RPA4Q13156 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPA4Q13156 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPA4Q13156 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPA4Q13156 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPA4Q13156 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPA4Q13156 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPA4Q13156 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPA4Q13156 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPA4Q13156 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPA4Q13156 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPA4Q13156 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPA4Q13156 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPA4Q13156 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA4Q13156 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA4Q13156 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA4Q13156 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPA4Q13156 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPA4Q13156 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPA4Q13156 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPA4Q13156 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPA4Q13156 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA4Q13156 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA4Q13156 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPA4Q13156 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPA4Q13156 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPA4Q13156 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPA4Q13156 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPA4Q13156 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPA4Q13156 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPA4Q13156 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPA4Q13156 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPA4Q13156 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPA4Q13156 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPA4Q13156 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RPA4Q13156 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RPA4Q13156 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RPA4Q13156 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPA4Q13156 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPA4Q13156 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPA4Q13156 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPA4Q13156 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPA4Q13156 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPA4Q13156 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPA4Q13156 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPA4Q13156 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPA4Q13156 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPA4Q13156 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPA4Q13156 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RPA4Q13156 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPA4Q13156 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPA4Q13156 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.8 ms