Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACACAQ13085 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACACAQ13085 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms