Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAF2Q12933 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAF2Q12933 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAF2Q12933 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF2Q12933 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF2Q12933 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF2Q12933 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF2Q12933 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF2Q12933 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF2Q12933 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF2Q12933 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF2Q12933 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAF2Q12933 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF2Q12933 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF2Q12933 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF2Q12933 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF2Q12933 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF2Q12933 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAF2Q12933 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF2Q12933 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF2Q12933 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF2Q12933 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF2Q12933 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF2Q12933 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF2Q12933 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF2Q12933 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF2Q12933 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF2Q12933 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF2Q12933 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF2Q12933 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF2Q12933 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAF2Q12933 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAF2Q12933 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF2Q12933 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF2Q12933 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF2Q12933 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF2Q12933 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF2Q12933 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF2Q12933 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF2Q12933 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF2Q12933 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAF2Q12933 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAF2Q12933 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAF2Q12933 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAF2Q12933 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAF2Q12933 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAF2Q12933 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAF2Q12933 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF2Q12933 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF2Q12933 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF2Q12933 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF2Q12933 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF2Q12933 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF2Q12933 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF2Q12933 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF2Q12933 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF2Q12933 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF2Q12933 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF2Q12933 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF2Q12933 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAF2Q12933 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAF2Q12933 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms